Сезон 3 е излъчен между март 2007 и юли 2007.
Лист с епизоди[]
Промоционална обложка за сезона.
Коледен специален епизод[]
| # | Име | Сценарист | Бележки |
| N/A | Булката Беглец | Ръсел Дейвис |
Редовен Сезон[]
| # | Име | Сценарист | Бележки |
| 1 | Смит и Джоунс | Ръсел Дейвис | Първо появяване на Марта Джоунс и Джъдууните |
| 2 | Шифърът на Шекспир | Гарет Робъртс | |
| 3 | Задръстване | Ръсел Дейвис | Първо показване за новите серии на Макра, последно показване на Лицето на Бо |
| 4 | Чт. 1: Далеци в Манхатън Чт. 2: Еволюцията на Далеците |
Хелън Райнър | Завръщане на Култа към Скаро |
| 5 | Възкръсването на Лазар | Стивън Грийнхорн | |
| 6 | 42 | Крис Чибнал | |
| 7 | Чт. 1: Човешкото ми аз Pt. 2: Кръвното Семейство |
Пол Корнел | |
| 8 | Мигване | Стивън Мофат | Първо показване на Ридаещите Ангели |
| 9 | Чт. 1: Утопия Чт. 2: Звукът от барабаните Чт. 3: Последният от Господарите на Времето |
Ръсел Дейвис | Първо показване за новите серии на Властелина. Завръщане на Джак Харкнес. Последно появяване на Марта Джоунс като придружителка. |
Анимиран специален епизод[]
| # | Име | Сценарист | Бележки |
| N/A | Безкрайното Търсене | Алън Барнс | Оригинално показан в 13 части (по 3:30 всяка) в Totally Doctor Who, по-късно излъчен отново като 45 минутен епизод |
Награди[]
Сериалът печели Saturn Award за 2008 в категорията "Най-добър световен сериал", след като е излъчен по американския канал SyFy (тогава Sci Fi).