Anubis ist ein Osirianer und wird in der ägyptischen Mythologie als schakalköpfiger Gott der Totenriten und der Mumifizierung verehrt.
Er ist der Sohn des Sutekh. Als dieser nach seinem Putsch gegen Osiris zum ewigen Exil auf der Erde verurteilt wird, muss auch Sutekhs Verbündete Nephthys eine harte Strafe über sich ergehen lassen. Um 5000 v. Chr. wird ihr Geist im Körper eines jungen Mädchens gefangen. Gemeinsam mit Horus trennt Anubis Nephthys' Geist in Instinkt und Verstand. Anubis verschließt den Verstand seiner Tante in einem Kanopenkrug und gibt seinen Priestern die Anweisung, das Mädchen, in dem die Instinkte von Nephthys für immer verwahrt bleiben sollen, lebendig zu mumifizieren (The Sands of Time).
Wie die anderen Osirianer verlässt auch Anubis dann die Erde.
2014 kehrt Anubis auf der Suche nach einem Quanten-Ernter auf die Erde zurück. Er will damit ein Tor bauen, um den anderen Osiranern in ein anderes Universum zu folgen. Der Doctor überzeugt Anubis davon, seine Pläne um fünftausend Lebenszyklen zu verschieben, da das Tor einen Welleneffekt verursachen und damit das Universum zerstören würde. Der Doctor verspricht Anubis, nach einem anderen Weg zu suchen, der ihn mit seinem Volk wieder vereint. Derweil begleitet Anubis Dorothy Bell, die sich mit dem Quanten-Ernter verschmolzen hat (Spiral Staircase, Sins of the Father).
Anubis ruft den Doctor zur Shining Horizon und bittet ihn, in der fernen Vergangenheit zum Amenthes zu reisen, um ein Zepter für ihn zu holen. Doch während der Doctor und Cindy unterwegs sind, übernimmt Sutekh die Kontrolle über Anubis. Er begibt sich zum zentralen Kern der Shining Horizon und bewegt das in Übereinstimmung mit dem Kreis der Transzendenz. Anubis versucht gegen seinen Vater anzukämpfen, indem er Gabby beschützt und sie entkommen lässt, aber Sutekh überwältigt ihn bald und befreit einige seiner Verbündeten, denen Sutekh in der Leere, in der er gefangen war, begegnet war. Anubis, immer noch unter Sutekhs Kontrolle, hetzt Roboter-Mumien auf den Doctor los.
Er begibt sich in den Garten des Osiris, wo er Cindy daran hindert, Sutekh zu lähmen, doch Dorothy opfert sich schließlich, um Sutekh endgültig zu besiegen. Bevor sie stirbt verjüngt sie Anubis und löscht sein Gedächtnis, was ihn zu einem sanften Bewohner des Gartens macht, der dem Doctor und seinen Begleiterinnen Booji-Saft serviert (Old Girl).