El Duodécimo Doctor es el resultado de la explosiva regeneración del Undécimo Doctor en Trenzalore, producto de la "regeneración número trece". Se trata de la primera encarnación del segundo ciclo de regeneraciones del Doctor, proporcionado gracias a los Señores del Tiempo.
Con conocimiento de la supervivencia de Gallifrey, ya no tiene el sentimiento de culpabilidad característico de sus encarnaciones pasadas. Es un personaje más oscuro que incluso ha llegado a cuestionar su propia moral. Aunque tenía rasgos de bondad y un buen sentido del humor, a menudo los deja de lado en situaciones tensas, pasando a ser frío y calculador en momentos críticos que necesitan buen juicio y la toma de decisiones agudas.
Por desapegarse de las emociones, puede resultar desagradable, temible y despiadado. Estas cualidades tienden a aterrorizar a aquellos a su alrededor, incluso a sus acompañantes. Se convirtió en alguien más difícil de confiar y reconoció su cambio de personalidad a una más negativa, sintiéndose indignado y temeroso de en qué se estaría convirtiendo.
A diferencia de las aventuras de su predecesor con Clara, este Doctor tenía una relación algo más tensa con ella; Clara estaba saliendo con su compañero de Coal Hill, Danny Pink, quien no gustaba al Doctor (un desagrado mutuo).
Sin que lo supiese, estaba siendo espiado por Missy, la más reciente encarnación del Amo; Missy fue la responsable de asegurarse de que Clara fuese su acompañante. Tras impedir sus planes de convertir a los muertos en un ejército de Cybermen (algo que ella le quería dar como regalo de cumpleaños para demostrar que ambos eran iguales), el Doctor se reunió con viejos amigos.
El Doctor tuvo una revelación de que había elegido un rostro familiar para recordarse a si mismo de que tenía que salvar a las personas. Decidió usar tecnología de la especie de los Mire revivir a Ashildr, una chica vikinga que había fallecido protegiendo a su pueblo de los Mire, provocando que ella se volviese inmortal. Tras un encuentro con Ashildr en un campamento de refugiados alienígenas en el que Clara acabó falleciendo, el Doctor fue transportado al interior de su propio disco de confesión para ser forzado la identidad del Híbrido. Durante un período que duró billones de años, el Doctor estuvo en un bucle en el que quemaba su cuerpo viejo para permitir que una nueva versión de si mismo llegara al disco de confesión. Cuando por fin consiguió liberarse y salir del disco, atravesó un portal hacia Gallifrey, donde desterró a Rassilon y se convirtió en el nuevo presidente, aunque su verdadera intención era la de recuperar a Clara. El Doctor cruzó varios límites en su intento de salvarla, pero finalmente fracasó y perdió sus recuerdos relacionados con ella.
El Doctor se reencontró con su mujer, River Song, aunque ella desconocía esta encarnación ya que creía que el Doctor había agotado todas sus encarnaciones. En medio de una peligrosa persecución, River hizo varias afirmaciones sobre el Doctor, llegando a revelar que creía que él era incapaz de amar a otros y quejándose de que él no apareciera cuando ella lo necesitaba. River acabó descubriendo que el Doctor había estado con ella todo el tiempo y los dos acabaron colisionándose contra el planeta Darillium, lugar donde sabían que tendrían su última cita. El Doctor y River pasaron juntos una larga noche que duró 24 años antes de que ella se dirigiera hacia su destino final.
Historia
Preparaciones
Durante una visita a un universo paralelo en el que es un personaje ficticio en una serie de televisión, el Undécimo Doctor le dijo al actor que lo interpretaba, Matt Smith, que Peter Capaldi, a quien previamente rescató de un Mandrel, sería una buena elección para interpretarlo en la serie. (CÓMIC: The Girl Who Loved Doctor Who)
Tras la regeneración
Después de haber luchado en el asedio de Trenzalore durante 900 años, (PROSA: Tales of Trenzalore: The Eleventh Doctor's Last Stand), el Undécimo Doctor, a punto de ser exterminado por los Daleks a una edad avanzada, estaba preparado para aceptar que había alcanzado el final de su vida. Incapaz de aceptar este hecho, Clara Oswald apeló a los Señores del Tiempo para que interviniesen y el Doctor recibió un nuevo ciclo de regeneraciones. Tras utilizar su energía regenerativa para destruir la nave madre Dalek, volvió a su TARDIS para completar la regeneración.
Cambiando de repente en un flash ante Clara, el nuevo Doctor mencionó su sorpresa por tener nuevos riñones. La TARDIS empezó a vibrar bruscamente y el Doctor dio a entender que se había olvidado de cómo pilotar su nave, sorprendiendo a Clara. (TV: The Time of the Doctor)
Colisionando en la Tierra prehistórica, la TARDIS acabó siendo perseguida y tragada por una Tiranosaurio hembra; el Doctor transportó a la TARDIS hacia Londres en los años 1890 y el dinosaurio fue llevado junto con ellos.
La TARDIS fue escupida por el dinosaurio y el Doctor, sufriendo del trauma posterior a la regeneración, actuó de forma salvaje e irracional. Se asomó por la puerta de la TARDIS, hizo callar a Strax y volvió al interior, cerrando la puerta. Luego, salió de la TARDIS y trató de identificar a Strax como a uno de los Siete Enanitos. Incapaz de acordarse de nombres y de rostros con claridad, farfulló al ver al Equipo de Paternoster y se le acercó la agotada e irritada Clara, que intentó tener algo de control de su enloquecido estado.
Aunque lo metieron en la cama para que se estabilizase, el Doctor no tardó en despertarse y recogió un trozo de tiza para escribir por toda la habitación una serie de ecuaciones peculiares. Oyendo el sufrimiento del tiranosaurio, el Doctor subió hacia el tejado y luego se apoderó de un caballo tras ver al dinosaurio ser quemado y reducido a cenizas. El Doctor deambuló por las calles de Londres, dispuesto a investigar pero aún sufriendo por el estrés de la regeneración. El Doctor se encontró con un mendigo y estuvo hablando con él acerca de sus nuevos rasgos faciales, notando especialmente sus nuevas pestañas y su acento escocés. A continuación, se cambió el reloj favorito de su encarnación anterior por la chaqueta y los guantes del mendigo. (TV: Deep Breath)
Viendo en un periódico un anuncio dejado por Missy, (TV: Death in Heaven) que parecía ser un mensaje de Clara, el Doctor se infiltró en un restaurante sospechoso en el que él y Clara descubrieron que droides de relojería que había viajado en el tiempo liderados por el Hombre con media cara han estado cosechando a humanos para poder repararse a ellos mismos y llegar a la Tierra Prometida. El Doctor trató de hablar pacíficamente y de descubrir la verdad acerca de la existencia de la Tierra Prometida. El hombre con media cara acabó cayéndose de su cápsula de escape, sin saberse si saltó o fue empujado por el Doctor.
A continuación, el Doctor redecoró la sala de la consola de la TARDIS, decidió su nueva vestimenta y habló con Clara acerca de la forma distinta con la que lo conocía en su encarnación previa. Clara, que no estaba segura sobre la identidad del Doctor, pidió que la lleve de vuelta a casa. Él intentó hacerlo, pero acabó aterrizando en Glasgow por error. No obstante, Clara decidió ir a por un café con el nuevo Doctor después de recibir una llamada del Undécimo Doctor animándola a ayudar al Doctor con su regeneración. (TV: Deep Breath)
¿Soy un buen hombre?
El Doctor dejó a Clara atrás en Glasgow para ir a por café y acabó compartiendo una aventura con un mutante llamado 78351. (PROSA: Lights Out)
Aún con intención de regresar con el café, el Doctor salvó del ataque de un platillo Dalek a Journey Blue, piloto de caza de la Resistencia Galáctica Combinada, aunque su hermano se quedó atrás en la explosión. Tras hacer que lo pidiese con educación, el Doctor llevó a Journey a la nave de comando, la Aristóteles, donde el coronel Morgan Blue le enseñó a un Dalek que se había convertido en bueno por un fallo.
El Doctor regresó a por Clara, llegando tres semanas después de que se marchase a por café (según la perspectiva de Clara) y se tomó un momento para preguntar si ella creía que él era un buen hombre, cosa que ella fue incapaz de responder; los dos se dirigieron a la base para ayudar al Dalek. Junto con Journey y dos otros soldados (Gretchen Carlisle y Ross), el Doctor y Clara utilizaron un nanoescalador molecular para miniaturizarse y entraron en el Dalek — apodado como "Rusty" por el Doctor. Tras perder a Ross ante los anticuerpos del Dalek, el Doctor descubrió una fuga de radiación dentro del Dalek y notó que se este se había convertido en bueno en cuanto vio a una estrella nacer. Siguiendo la radiación, el Doctor descubrió que el daño a la fuente de poder de Rusty lo estaba matando lentamente y reparó el daño con su destornillador sónico.
El arreglo del núcleo de poder de Oxidado hizo que se revirtiese el fallo que lo estaba haciendo ser bueno, provocando el retorno de su naturaleza destructiva y haciéndole cometer una serie de asesinatos y enviar una señal de emergencia que atrajo a los Daleks a la base de los rebeldes. Clara abofeteó y reprimió al Doctor por su apatía y él se dio cuenta de que podría hacer a Oxidado ser bueno otra vez si lograse hacerlo recordar la memoria de la estrella naciendo.
Enviando a Clara a buscar una forma de restaurar las memorias de Rusty, el Doctor se desplazó hacia el mutante Kaled dentro de Rusty para poder enlazar su mente con la del Dalek, haciendo a Rusty apreciar su odio hacia los Daleks y llevándolo a destruir a los demás Daleks que habían respondido a su señal. Antes de marcharse para continuar su cruzada contra los Daleks, Rusty comentó que el Doctor habría sido un buen Dalek.
El Doctor rechazó la petición de Journey de viajar con él (por ser una soldado) y llevó a Clara de vuelta a casa. Ambos no estaban seguros de si el Doctor era un buen hombre, pero Clara expresó estar convencida de que al menos, él lo estaba intentando. (TV: Into the Dalek)
Nuevas aventuras con Clara
Pasando más tiempo a solas, el Doctor descubrió a una criatura que se disfrazó como autopista para consumir a planetas hacia otras dimensiones. Solicitó la ayuda de Clara y se sorprendió cuando la criatura desapareció, sin saber que Clara la engañó para que se consumiese a si misma. (CÓMIC: Road Rage) Él y Clara ayudaron al Equipo de Paternoster a impedir los planes de Orestes Milton de convertir a personas en armas. (PROSA: Silhouette)
El Doctor decidió dejar a Clara elegir el lugar de su siguiente aventura y ella pidió que acudiesen al bosque de Sherwood para conocer a Robin Hood, aunque él dudaba de la existencia de Robin. Inmediatamente al aterrizar vio que se equivocaba, ya que Robin disparó a la TARDIS con una flecha; sin embargo, siguió determinado a demostrar que Robin Hood y sus hombres eran falsos.
Tras un concurso de tiro al arco para ganar una flecha dorada, el Doctor, Clara y Robin fueron capturados por el Sheriff de Nottingham, que se alió con robots alienígenas disfrazados como sus caballeros. El Doctor escapó y averiguó que los robots estaban intentando llegar a la Tierra Prometida pero no disponían de suficiente oro para reparar su motor. El Doctor, que creía que Robin era otro robot, fue capturado por el Sheriff mientras Clara y Robin escaparon por una ventana. El Doctor fue informado por el Sheriff de que Robin Hood no era un robot justo cuando Robin apareció para rescatarlo, derrotando al Sheriff. El Doctor y Clara ayudaron a Robin a disparar la flecha dorada hacia la nave de los robots, permitiendo su llegada al espacio para que explotase allí sin causar ningún daño colateral.
Robin, sabiendo cosas sobre la historia del Doctor gracias a Clara, señaló que los dos no eran tan distintos. Ambos eran personas que habían nacido con estatus y privilegio, renunciando a ambas cosas para vivir la vida como aventureros luchando contra la injusticia. (TV: Robot of Sherwood)
El Doctor y Clara utilizaron una bomba pegajosa para impedir los intentos de Sibro de armar una torre de reloj conlaniana, (CÓMIC: Chime Time) consiguieron llegar a un alto el fuego en una guerra entre perros y gatos antropomórficos aliándolos para luchar contra un ejército de pulgas alienígenas que estaban planeando atacar todos los planetas del universo, (CÓMIC: Once Bitten) y ayudaron al Mundo Cerebro a encontrar una nueva forma de vida después de chocarse en su planeta de fábricas. (CÓMIC: Crash Landing)
Mientras investigaba la corrupción en una colonia distante, el Doctor acabó siendo culpado por varios crímenes y encarcelado en la prisión asteroide de la colonia hasta que expuso su más oscura medida de seguridad. (PROSA: The Blood Cell)
En su visita al planeta Hoopoe, el Doctor actuó como abogado de Clara cuando ella fue arrestada por la Corte de Pájaros por caminar en el suelo. Su intento de convencerlos de que ellos no son gatos resulta contraproducente, ya que los búhos los acusan de ser ratones, pero el Doctor lo veía venir y reclutó a los gatos nativos para atacar a los búhos con alas improvisadas, asegurándose de que las alas fuesen muy difíciles de utilizarse bien para que no lograsen perseguir a los búhos. Yéndose con Clara en la TARDIS, el Doctor recompensó a los gatos con una caja de atún enlatado. (CÓMIC: The Court of Birds)
El Doctor se obsesionó con la idea de que una criatura diseñada para ocultarse podría estar siguiendo a él y a todo el mundo de forma similar. Visitando a Clara para pedir ayuda, él utilizó los circuitos telepáticos de la TARDIS para pilotar hacia el pasado de Clara. Ella sin embargo se distrajo por una llamada telefónica de Danny Pink, con quien tuvo una cita, provocando que acabasen en el pasado de Danny — momento en el que tan solo era un niño y se llamaba Rupert. Cuando una figura fue encontrada bajo la sábana de Rupert, el Doctor hizo que Clara y el niño se girasen para permitir a la criatura salir de la habitación sin ser observada.
El Doctor llevó a Clara de vuelta a su cita con el adulto Danny Pink mientras continuaba siguiendo su teoría, tratando de utilizar rastros dejados por Clara en los circuitos telepáticos y acudiendo al fin del universo, donde un viajero del tiempo, el coronel Orson Pink (descendiente de Danny) había estado atrapado desde hacía seis meses. Intrigado sin saber cómo la línea temporal de Clara le llevó hacia Orson, el Doctor regresó a por Clara y los tres se quedaron en el fin del universo para esperar a la noche, ya que él creía que aquél era el momento idóneo para descubrir si la criatura que se ocultaba era real o no.
Con una oportunidad de confrontar a la criatura, el Doctor hizo que Clara se quedase dentro de la TARDIS y pareció poder echar un vistazo a lo que estaba buscando, pero se rompió el escudo atmosférico y Orson tuvo que salir a rescatarlo. Con el Doctor inconsciente y la TARDIS aparentemente sufriendo un ataque, Clara utilizó los circuitos telepáticos para escapar de allí.
Al despertarse y ver que Clara no está, el Doctor la llamó y sin querer alertó a una versión joven de él mismo, haciendo que descubriese la presencia de Clara. Antes de poder salir a investigar, Clara volvió a la TARDIS y le obligó a prometer marcharse sin averiguar el lugar en el que habían estado. El Doctor devolvió a Orson y a Clara a las épocas de cada uno y, satisfecho ante sus hallazgos, subrayó la palabra "Escucha" que había escrito la criatura en su pizarra. (TV: Listen)
El Doctor quiso reunirse con Clara en la escuela Coal Hill, pero en vez de ello, acabó en una réplica de la escuela en un planeta desconocido, donde Clara y Jeff Delobel, un profesor de francés, habían sido secuestrados por alienígenas primitivos que planeaban infiltrarse en la Tierra a través de la escuela Coal Hill. Para impedir la invasión, el Doctor contó a los alienígenas la historia del Guardián de la Tierra, informando de que él era el guardián y asustándolos. (CÓMIC: The Monsters of Coal Hill School)
Retomando sus viajes, el Doctor y Clara ayudaron a varados Seevith a pilotar su nave, (CÓMIC: More Than Meets the Eye) y permitieron que el profesor Faster acabase con los juicios de brujas del siglo XVII. (CÓMIC: Witch Work)
El Doctor apareció para recoger a Clara, persuadiéndola para que viajase con él en vez de ir a su cita con Danny Pink. Él recibió una llamada de la señora Karabraxos, quien le pidió que liberase al Delator y a su pareja del banco de Karabraxos, cosa que él ya hizo el día en que ella le conoció. Dándose cuenta de las ramificaciones de esta petición, el Doctor se hizo pasar por "el Arquitecto", utilizando esta identidad para preparar un atraco al banco para que lo llevase a cabo una versión futura de él mismo con la ayuda de Clara, un humano aumentado llamado Psi y una humana mutante llamada Saibra.
Utilizando gusanos de memoria para olvidarse del plan e impedir que el Delator alertase a la joven Karabraxos, el Doctor y Clara se despertaron estando ya en el banco con sus cómplices, siendo su última memoria el teléfono de la TARDIS sonando.
El grupo recibió instrucciones del Arquitecto acerca de su ubicación, objetivo y el sistema de seguridad del banco. Acto seguido, se infiltraron en el interior y activaron una bomba de cambio dimensional encontrada en una caja de seguridad para acceder al pasillo de servicio, lugar en el que encontraron un maletín con seis dispositivos de teletransporte que al principio parecían ser desfibradores atómicos.
Creyendo haber perdido a Saibra y a Psi por los desfibradores para librarse del Delator, el Doctor dedujo que el viaje en el tiempo era algo relacionado con el atraco, ya que una tormenta solar se produjo en el momento exacto y desbloqueó la cámara acorazada. El Doctor y Clara cogieron los objetos que el Arquitecto prometió a Psi y a Saibra como pago, pero fueron capturados por el Delator y llevados ante la Sra. Delphox, gerente del banco. Delphox ordenó su ejecución y se marchó, pero el Doctor y Clara fueron salvados por Psi y Saibra, que revelaron en qué consistían realmente los "desfibradores".
Acudiendo a la cámara privada del banco para encontrar su recompensa y la de Clara, el Doctor encuentró a la directora Karabraxos, descubriendo que Delphox y una mayoría de los empleados del banco eran clones exactos de Karabraxos. Viendo el odio de Karabraxos a sus propios clones, el Doctor tuvo una epifanía respecto a la identidad del Arquitecto y proporcionó el número de la TARDIS a Karabraxos antes de su retirada para escapar de la tormenta solar, que estaba a punto de destruir el banco.
Sometiéndose a los poderes del Delator, el Doctor recuperó sus memorias perdidas y recordó el verdadero objetivo del atraco. Liberó al Delator y a su pareja, llevándolos hacia otro planeta para que viviesen en paz; también transportó a Psi y a Saibra a sus respectivos destinos dando a ambos sus recompensas y llevó a Clara de vuelta a casa para su cita. (TV: Time Heist)
El Doctor y Clara se enfrentaron a los Wyrresters durante su segundo intento de invadir la Tierra, con el Doctor viajando hacia el pasado para asegurarse del fracaso de su primer intento y Clara intercambiándose de cuerpo con un Wyrrester durante un breve momento antes de su derrota. (PROSA: The Crawling Terror)
El Doctor y Clara se quedaron a merced de las pirañas de tierra estando encadenados a postes en un planeta desierto, pero se reencontraron con personas pez, (TV: The Caretaker) fueron salvados de una bestia de limo de Aaraanandal por un superviviente de la invasión Dalek del siglo XXII llamado Simon, (PROSA: When the Wolves Came) y huyeron de soldados para escapar en la TARDIS. (TV: The Caretaker) Durante la Navidad, el Doctor y Clara salvaron a un pequeño pueblo de un Cephla. (CÓMIC: Gift Snatched!)
El Doctor quiso visitar Edén 2 y se llevó a una reacia Clara, que le había llamado para pedir que la dejase en la escuela por haberse quedado dormida. Cuando el dúo llegó, el planeta resultó ser una trampa para atraer y arrestar a invasores de planetas. Creyendo que personas inocentes acabarían siendo castigadas injustamente, el Doctor situó una baliza con un aviso alrededor del planeta y dejó a Clara en la escuela Coal Hill. (CÓMIC: Freeze)
Conociendo a Danny y a Courtney
El Doctor descubrió a un Skovox Blitzer cerca de la escuela Coal Hill y empezó a trabajar encubierto temporalmente como nuevo conserje para poder encargarse del robot asesino, cosa que perturbó a Clara.
El plan inicial del Doctor de enviar al Blitzer hacia el futuro fue impedido accidentalmente por Danny Pink. Clara presentó a Danny como su novio, algo que el Doctor no aprobó por tratarse de un antiguo soldado y por creer que no era lo suficientemente bueno para Clara. El Doctor tuvo una idea para un segundo plan: utilizar un dispositivo de comunicación para hacer al Blitzer creer que él era su superior.
Tras comandar al Blitzer para que se desactivase con la ayuda de Danny, el Doctor se lo llevó al espacio y lo echó de la TARDIS, siendo acompañado por la problemática alumna Courtney Woods después de que ella descubriese su identidad y decidiendo que no pasaría nada por tenerla como compañera, (TV: The Caretaker) aunque él no vui nada especial en Courtney, lo cual hirió sus sentimientos y provocó que se portase mal. (TV: Kill the Moon)
Otras aventuras con Clara
El Doctor y Clara viajaron hacia el planeta Isen VI para que Clara pudiese esquiar, practicando para una actividad extraescolar. A pesar de que el Doctor lo recordaba como un planeta frío y nevado, se había convertido en un paraíso cálido y tropical. Rescatando a Clara de criaturas similares a monos, el Doctor encuentró una hoja artificial, lo cual lleva a ambos a ser acusados de allanamiento por el dueño del planeta, Kano Dollar. El Doctor descubrió que, como consecuencia de la manipulación del planeta, un cataclismo global era inminente, pero Dollar no le hizo caso.
El Doctor y Clara rescataron de un terremoto subterráneo a dos trabajadores con la TARDIS y se dirigieron a una cueva bajo la torre. Además, el Doctor halló una señal de Gallifrey y se dispuso a investigar. Encontraron a un terraformer gigante fusionado con una nave bajo la tierra. Desde la nave surgió un Hyperion llamado Rann-Korr, que anunció la caída del universo.
El Doctor liberó los gases refrigeradores de la nave, lo que permitió que tanto él como los demás escapasen hacia la TARDIS. Él explicó que la reanimación de Rann-Korr era el resultado del trabajo del terrorformer y admitió no tener ningún plan para derrotarlo. Volviendo a la superficie, ellos hicieron planes con los trabajadores. El Doctor regresó para confrontar a Rann-Korr en un enfrentamiento final. Según Rann-Korr se preparó para matar al Doctor, la terraformación se revirtió, convirtiendo a la zona de Isen VI a su alrededor en su estado original de hielo. El Doctor escapó en la TARDIS y Rann-Korr falleció en el hielo. El Doctor y Clara se despidieron de los trabajadores y se marcharon. (CÓMIC: Terrorformer)
Mientras Clara esperaba a que Leonardo da Vinci le pintase un retrato en 1505, el Doctor recibió un aviso de Tiger Maratha para acudir a India en el año 2315. El Doctor y Clara llegaron a 2315 y descubrieron que Tiger había sido asesinado, momento en que la policía confronta al Doctor y a la hija de Tiger, Priyanka Maratha. Tras escapar, Priyanka dijo al Doctor y a Clara que Tiger trabajó para un grupo conocido como la familia Scindas. El Doctor, Clara y Priyanka viajaron hacia el hogar ancestral de los Scindas para encontrar información, aunque el Doctor pasó por una puerta dimensional y acabó en India en 1825, siendo atacado por un demonio pero rescatado por la amazona renegada Rani Jhulka. El Doctor y Rani encontraron a una necro-nube cultivando los espíritus de los muertos y fueron atacados por más demonios. Cuando estaban apunto de ser derrotados, apareció la TARDIS, ya que Priyanka activó sin querer los circuitos telepáticos. Ella informó al Doctor de que los demonios se habían llevado a Clara.
De vuelta a 2315, el Doctor, Priyanka y Rani encontraron un mensaje final grabado por Tiger antes de su muerte en el que explicaba que recogió tres de las cuatro espadas míticas de la diosa Kali para la familia Scindas y tuvo una premonición de maldad en las espadas. El Doctor tuvo que acudir a ver a Chandra Scindas, patriarca de la familia Scindas. Él dedujo que eran seres conocidos como los Kaliratha, imponiéndose por el espacio, el tiempo y la mitología hindú. Chandra reveló que tenía a Clara como rehén, preparada para arder en llamas junto al cohete Éxodo, obligando al Doctor a acceder a encontrar la cuarta espada de Kali para ellos. El Doctor, Priyanka y Rani consiguieron la espada y regresaron con Chandra, que reveló haber utilizado a Clara como huésped para la resurrección de Kali. Mientras el Doctor combatía contra Kali, Priyanka consiguió controlar al cohete. El Doctor reveló que ocultó su destornillador sónico en la cuarta espada para que Kali liberase sin querer los espíritus malvados de si misma y el cuerpo de Clara; mientras, Rani mató a Chandra. Posteriormente, el Doctor, Clara, Rani y Priyanka acudieron juntos a un festival en Mumbai. (CÓMIC: The Swords of Kali)
Intentando poner flores en el exterior de la TARDIS, El Doctor se asustó al ver a una futura Clara y cayó fuera de la TARDIS en la órbita de un asteroide. Cuando el intento de Clara de evitar eso terminó causándolo, la TARDIS pudo salvar al Doctor creando un escudo de tiempo a su alrededor. (PROSA: A Long Way Down)
Problemas con Clara
A petición de Clara, el Doctor se llevó a ella y a Courtney a la Luna en el año 2049 para que Courtney pudiese ser la primera niña en la Luna y dejase de creer que no era importante. En vez de aterrizar directamente allí, ellos aparecieron en una lanzadera espacial reciclada en dirección a la Luna. El Doctor fue informado por la capitana Lundvik de que la luna había ganado mucho peso e iban a utilizar bombas nucleares para deshacerse de ese peso adicional.
Investigando una base minera de una misión previa, el Doctor, sus acompañantes y los astronautas encontraron cuerpos preservados en telarañas e investigación que sugiería que la luna se había estado desintegrando. Poco después, el grupo fue atacado por una criatura arácnida a la que Courtney mató con equipamiento de limpieza, aunque el equipo de Lundvik falleció.
Llevándose a la asustada Courtney de vuelta a la TARDIS, el Doctor mencionó a Clara que no estaba seguro del destino de la Luna, definiendo esos eventos como un "área gris" en el tiempo. Explorando la superficie lunar para averiguar el motivo del deterioro, el Doctor, Clara y Lundvik descubrieron a una horda de gérmenes araña y fluido amniótico. El Doctor decidió adentrarse en el interior de la Luna para encontrar respuestas.
Escaneando el núcleo de la Luna, el Doctor descubrió que en realidad, la luna consistía en un huevo de una criatura muy antigua que se había estado incubando. Reuniéndose con Clara y Lundvik después de la caída de la lanzadera y de la TARDIS en un cañón, el Doctor les informó sobre lo que estaba pasando tras establecer contacto con el teléfono de Courtney. Mientras Clara y Lundvik discutían acerca de la posibilidad de eliminar a la criatura por el bien de la Tierra, el Doctor hizo que Courtney llevase la TARDIS hacia él y comentó que él no era quien para decidir el futuro de la Luna. Se marchó en su TARDIS dejando a Clara, Lundvik y Courtney atrás para tomar la decisión en nombre de la humanidad.
Cuando Clara decidió perdonar a la criatura (a pesar de los votos de la humanidad a favor de su muerte), el Doctor regresó a por las tres, transportándolas a una playa en la Tierra para ver a la criatura salir del cascarón y a la Luna desintegrarse de forma inofensiva en la atmósfera de la Tierra. Confirmando que este incidente hizo que los humanos volviesen a tener interés por adentrarse en el espacio y viendo a la criatura dejar otro huevo con la misma masa de la vieja Luna, el Doctor regresó con Courtney y Clara a la escuela Coal Hill.
Enfadada por la posición en que le puso el Doctor, Clara le preguntó si sabía que el huevo era inofensivo y él dijo que sí. Cansada de la apatía del Doctor, ella discutió con él muy molesta por haber estado a punto de matar a una criatura nonata por su culpa. Él afirmó que quería ayudar a la raza humana al no involucrarse en la decisión, pero Clara, herida por su actitud condescendiente hacia la humanidad, sintió que él la veía como a una idiota. Entre lágrimas, le dijo que se marchase y no volviese a por ella. El Doctor se quedó aturdido por su reacción y se fue inmediatamente. (TV: Kill the Moon)
Viajando en solitario
Respondiendo a una señal de emergencia de un prisionero Dalek a bordo de una Cyber Nave, el Doctor descubrió que los Daleks, Cybermen y Sontarans habían estado buscando los Orbes de Destinos para poder controlar un poderoso arma de los Señores del Tiempo llamada el Starbane. El Doctor se alió con el prisionero Dalek, que fue alterado por los Cybermen y "vio la luz", al que apodó como "Grumoso". Siguiendo la energía Artron del orbe hacia las Cyber-tumbas de Telos, el Doctor restauró un mínimo de la energía de Grumoso (sin confiar en el Dalek para que utilizase todo su poder) y lo envió a recuperar el segundo orbe mientras se quedó estudiando el primero en la TARDIS.
Según Grumoso descendía hacia las profundidades de Telos, el Doctor descubrió que los orbes eran activados por energía temporal; la única forma de destruirlos era creando una implosión temporal. Saliendo de Telos para ir a Sontar, el Doctor y Grumoso fueron atrapados en un campo de estasis por el Mayor Skar, pero el Doctor logró abrir el campo y permitió a Grumoso escapar sin ser detectado mientras se quedaba atrás como distracción. En cuanto Grumoso se apoderó del último orbe y desactivó el campo de estasis, el Doctor escapó con él, decidiendo mantenerse alejado de Sontar durante un tiempo. (JUEGO: The Doctor and the Dalek)
En la noche de Navidad de 2014, el Doctor se alió con Ceri, un suplente, para impedir los intentos de unos Addos de recrear una obra teatral de Mummers alterando genéticamente a actores del Palace Theatre. (PROSA: Behind You)
Regreso de Clara
Reuniéndose con Clara para un viaje de despedida, el Doctor se la llevó al Orient Express espacial. Posteriormente, confesó que eligió ese lugar con esperanzas de que algo emocionante ocurriese, ya que fue atraído por llamadas telefónicas, invitaciones misteriosas y pases de tren gratuitos.
Tras la muerte de una pasajera anciana, el Doctor sintió la necesidad de investigar y se dirigió a la sala de máquinas para examinar el Extensor de Vida Excelsior de la fallecida, conociendo al ingeniero jefe Perkins en el proceso y enterándose acerca del rumor del Predicho (una supuesta momia). El Doctor buscó la opinión de Emile Moorhouse, otro de los pasajeros que es un profesor de mitología alienígena, y luego descubrió que hubo una segunda muerte en la cocina.
El Doctor confrontó al capitán Quell con su teoría, pero fue ignorado. Se reunió con Perkins y Moorhouse en la sala de máquinas para continuar su investigación de las muertes. Llamando a Clara para ponerla al corriente, el Doctor descubrió que ella y Maisie Pitt estaban atrapadas en un compartimiento de almacenaje en el que había un sarcófago. Temiendo que Clara estuviese atrapada con el Predicho, el Doctor trató de abrir la puerta, pero descubrió que el sarcófago estaba vacío y fue arrestado por el capitán.
No obstante, Quell presenció una tercera muerte y notó que el Doctor tenía razón, de modo que se alió con él, momento en que el Doctor dedujo la verdadera naturaleza del Orient Express; todos los pasajeros eran expertos y científicos en campos específicos de estudio, reunidos allí para estudiar al Predicho. Se reveló la existencia de un laboratorio y desaparecieron múltiples pasajeros que tan solo eran un holograma; el ordenador del tren, Gus, proporcionó a los científicos las instrucciones y el equipamiento necesario. Cuando falleció Moorhouse, el Doctor y Perkins descubrieron que el Predicho había estado yendo a por los pasajeros más débiles al comprobar el historial médico de las otras víctimas. Quell también fue asesinado por la criatura (debido a su estrés post-traumático), pero no sin antes observar y dar al Doctor la descripción necesaria para que derrotase al Predicho.
Dándose cuenta de que Maisie sería la siguiente por sus depresiones, el Doctor pidió a Clara que la llevase hacia el laboratorio. Allí, el Predicho se le apareció a Maisie, pero el Doctor la salvó implantando una réplica de su tristeza en su propia mente, confundiendo al Predicho para que viese al Doctor como Maisie. Suponiendo que el Predicho era un soldado anciano mejorado con tecnología, el Doctor se rindió y, tras un saludo final, el soldado se convirtió en polvo, desapareciendo y dejando atrás tan solo la tecnología que lo estaba manteniendo con vida.
Con el objetivo completado, Gus retiró el aire de la cabina, pero el Doctor trasladó a todos los pasajeros hacia la TARDIS para salvarlos. El Doctor intentó piratear a Gus para descubrir quien era su creador, pero esto accionó una medida de seguridad que provocó la autodestrucción del tren. El Doctor dejó a todos excepto Clara y Perkins en el planeta civilizado más cercano, quedándose a la espera de que Clara se despertase para explicarlo todo.
En la TARDIS, el Doctor invitó a Perkins a viajar junto con él, pero Perkins rechazó la invitación y ambos se despidieron. Reflexionando acerca de una conversación que tuvo con Maisie, Clara perdonó al Doctor y tomó la decisión de continuar viajando con él, comentando que su marcha fue idea de Danny. (TV: Mummy on the Orient Express)
Intentando llevar a Clara de vuelta a casa, el Doctor aterrizó sin querer en Bristol cuando criaturas desconocidas empezaron a drenar energía de la TARDIS, provocando que su exterior se redujese de tamaño. El Doctor envió a Clara a averiguar el motivo y volvió a entrar en la TARDIS para estudiar el efecto de reducción, pero la TARDIS se hizo aún más pequeña, dejándolo atrapado dentro. Equipando a Clara con su papel psíquico y el destornillador sónico, el Doctor utilizó nanotecnología para piratear el nervio óptico de Clara y establecer contacto visual con el mundo exterior. Clara consiguió la ayuda de un chico llamado Rigsy haciéndose pasar por el Doctor y el dúo descubrió que criaturas de un universo de dos dimensiones habían estado matando y diseccionando a ciudadanos de la zona para entender sus cuerpos de tres dimensiones.
El Doctor descubrió que un mural dedicado a los ciudadanos desaparecidos de la zona consistía en realidad en esas personas, asesinadas y situadas allí por las criaturas para su uso como camuflaje. Con Clara liderando un grupo de personas que habían estado prestando servicio a la comunidad, el Doctor pensó que las criaturas podrían estar tratando de comunicarse y las muertes podrían ser un simple malentendido. En cuanto vio que no era así, inventó un 2Dis — dispositivo capaz de revertir las habilidades de aplastamiento de las criaturas — mientras Clara y los demás entraban en un túnel subterráneo.
Clara accidentalmente dejó caer la TARDIS en las vías del tren y el Doctor activó el modo asedio de la TARDIS para protegerla de un tren cercano. Incapaz incluso de abrir las puertas y con el sistema de soporte vital de la TARDIS fallando, el Doctor felicitó a Clara por ser digna del título de Doctor, sin ni siquiera saber si ella le estaba escuchando. Clara y Rigsy fueron capaces de engañar a las criaturas y hacerlas abastecer la TARDIS con la energía necesaria para restaurar todas sus condiciones de funcionamiento. Nombrando a sus adversarios como los "Sin huesos", el Doctor los ahuyentó haciendo que regresasen a su universo natal y luego transportó a los supervivientes hacia la superficie. (TV: Flatline)
El Doctor pasó algo de tiempo en solitario y luego aterrizó en Londres, encontrándose con la ciudad y el resto del mundo completamente llenos de árboles. Maebh Arden, estudiante de Coal Hill bajo el cuidado de Clara y Danny en una actividad extraescolar, buscó al Doctor tras oír acerca de él en lo que ella interpretó como un pensamiento que obtuvo gracias a Clara. Con sus teorías resultando erróneas una y otra vez, el Doctor llegó a la conclusión de que el crecimiento repentino de los árboles consistía en un acto de agresión. Clara y Danny aparecieron para buscar a Maebh y los demás alumnos del grupo entraron en la TARDIS, algo con lo que el Doctor tuvo que lidiar. Maebh se escapó hacia el bosque y el Doctor notó que en un dibujo de sus tareas, ella predijo los acontecimientos de aquél día.
Siguiendo a Maebh en el bosque, el Doctor descubrió que una conciencia que se identifica como "la vida que prevaleció" había causado la aparición de los árboles como preparación para una devastadora erupción solar a punto de acertar la Tierra. Creyendo que la Tierra estaba condenada, Clara planteó utilizar la TARDIS como "bote salvavidas", pero luego reveló que solo lo dijo para que el Doctor regresase a la TARDIS y sobreviviese a la catástrofe por su cuenta. Aunque al principio se negó, Clara acabó consiguiendo que se marchase. Sin embargo, él siguió reflexionando y descubrió que los árboles absorberían los daños de la erupción dolar bombeando la atmósfera con oxígeno en exceso "como un airbag masivo y altamente inflamable". El Doctor corrió hacia Clara para explicárselo todo a ella y al grupo.
Al ser informado sobre la operación del gobierno con el objetivo de destruir los árboles, el Doctor accedió a todas las redes móviles del planeta y permitió a Maebh comunicarse a través de un discurso preparado por el grupo de alumnos para conseguir que dejasen en paz los árboles. Mientras Danny se encargaba de llevar a los niños a sus respectivos hogares, el Doctor y Clara observaron desde el espacio a los árboles alrededor de todo el mundo absorbiendo el fuego solar y luego volvieron al planeta para ver los árboles desaparecer desde el balcón de Clara. (TV: In the Forest of the Night)
La hora más oscura
El Doctor se reunió con Clara para un nuevo viaje, en el que ella sugirió que acudiesen a un volcán. Mientras el Doctor preparaba la TARDIS, Clara intentó poner un parche de ánimo en su cuello, pero él percibió lo que estaba haciendo y la engañó, poniéndolo en ella. Clara se imaginó que estaba en el volcán y lanzó todas las llaves de la TARDIS del Doctor hacia la lava, haciendo chantaje para forzarlo a salvar a Danny, que había fallecido. Clara se despertó de su sueño y, a pesar del intento de traición, el Doctor accedió a buscar a un "más allá" para encontrar a Danny.
Los dos aparecieron en 3W, lugar en el que habían esqueletos en tanques de agua. Ambos fueron recibidos por Missy, quien afirmó ser una androide y besó el Doctor como parte de su rutina de bienvenida, dejándolo aturdido. El Doctor y Clara conocieron al Dr. Chang, que les explicó el uso de agua oscura en el mausoleo. Clara acabó recibiendo una llamada de Danny, que estaba en la Infraesfera, y el Doctor y Chang la dejaron a solas para que respondiese.
El Doctor y Chang se encontraron en el pasillo a Missy retirando el agua de los tanques. Chang reveló que ella no era una androide, sino su jefa; ella eliminó a Chang y según se fueron quedando sin agua los tanques, el Doctor vio que lo que había en el interior eran Cybermen preparándose para una invasión en la Tierra. Escapando del edificio, se sorprendió al ver que estaba ubicado en la Londres del presente. Él intentó avisar a los ciudadanos cercanos para que se alejasen, pero Missy hizo que fuese ignorado y le informó de que es demasiado tarde. En este momento, el Doctor le preguntó por su verdadera identidad y ella hace la revelación de que era el Amo regenerado como mujer. (TV: Dark Water)
El Doctor y Missy fueron interceptados por UNIT y llevados hacia un avión, donde el Doctor fue nombrado presidente de la Tierra siguiendo los protocolos de UNIT para enfrentarse a la amenaza de los Cybermen. Missy consiguió liberarse e intentó matar el Doctor destruyendo el avión, pero el Doctor sobrevivió a la caída invocando a la TARDIS y accediendo a su interior. Él aterrizó en un cementerio y se encontró con Clara, que en ese momento estaba con un Danny convertido en Cyberman. Poco después, Missy apareció en la zona y puso todos los Cybermen bajo las órdenes del Doctor como un "regalo de cumpleaños".
Missy tenía el plan de convertir al Doctor en el líder del nuevo ejército, pero él se dio cuenta de que tan solo era un hombre en una cabina viajando por ahí, sin ser un buen hombre o uno malo, sin ser el líder de un ejército o un presidente. Acto seguido, él pasó el mando del ejército a Danny, que lideró a los Cybermen hacia el cielo para que explotasen y disipen las oscuras nubes desde las que había estado lloviendo el agua que convirtió a los muertos en Cybermen.
Posteriormente, Missy comentó al Doctor que Gallifrey se encontraba en su localización original y le proporcionó las coordenadas. Clara amenazó con matar a Missy por lo que le hizo a Danny, pero el Doctor se dispuso a hacerlo él mismo. De repente, un Cyberman que se quedó atrás disparó a Missy y la desintegró. El Doctor descubre que se trataba de su viejo amigo, el Brigadier Lethbridge-Stewart — resucitado como Cyberman — ayudándole una vez más. El Doctor le dirigió un saludo militar, cumpliendo un gran deseo de su viejo amigo.
Utilizando las coordenadas de Missy, el Doctor viajó en la TARDIS hacia el lugar indicado con esperanzas de encontrar Gallifrey, pero resultó que las coordenadas eran falsas y no llevaban a ningún sitio. Habiendo perdido su única forma de encontrar Gallifrey, el Doctor se puso a golpear la consola de la TARDIS en un ataque de furia hasta que se detuvo y se vino abajo, llorando tristemente.
Poco después, él se reencontró con Clara en una cafetería. Creyendo que Danny había regresado y ella estaba otra vez con él, el Doctor decidió mentir diciendo que había encontrado Gallifrey solo para permitir que ella continuase con su vida. Al oír esto, Clara comentó que está feliz y preparada para asentarse con Danny, aunque también mintió para no arruinar su momento (en realidad, Danny no había regresado del más allá). Los dos se dieron un abrazo y se despidieron. (TV: Death in Heaven)
Soñando con Santa Claus
Algún tiempo después, el Doctor fue atacado por un cangrejo del sueño, el cual lo puso en un sueño, donde él se encontraba viajando en su TARDIS, (TV: Last Christmas) aunque luego fue sacado de su ensimismamiento por alguien que estaba golpeando la puerta de la TARDIS. La persona en la puerta dijo que era evidente que ni él ni Clara estaban bien luego de una despedida tan triste. La persona en la TARDIS resultó ser Santa Claus, quien le preguntó al Doctor qué quería por Navidad. (TV: Death in Heaven)
El Doctor viajó a la casa de Clara para recogerla de su tejado, donde ella también había tenido un encuentro con Santa. Rogándole que crea en él, el Doctor logró llevarla a una base en el Polo Norte, donde descubrieron que se había llevado a cabo un ataque por parte de los cangrejos del sueño. Santa llegó también para ayudar a resolver el problema. Clara fue atacada por uno de los cangrejos y fue víctima de un estado de sueño. Puesto a que nadie encontró la forma de remover al cangrejo de su cabeza, el Doctor permitió que lo atacasen también, para poder rescatarla del sueño antes de que el cangrejo consumiese el cerebro de su acompañante.
Entrando al sueño de Clara, el Doctor descubrió que ella estaba soñando pasar una Navidad con Danny. El Doctor le pidió que despertase del sueño, luego de que Danny se despidiese de ella. Despertando en la base, el Doctor descubrió que en realidad, todos en la base estaban soñando, pues todos habían sido atacados por los cangrejos cuando llegaron. Despertaron de este sueño y tanto el Doctor como Clara se prepararon para partir, pero Clara le recordó al Doctor lo que había sucedido en el tejado de su casa, y él descubrió que realmente seguían soñando, y sus verdaderos seres no se encontraban en el Polo Norte. El personal infectado empezó a atacar a los sobrevivientes, pero finalmente todos, salvo uno de ellos, lograron escapar, pues soñaron que Santa Claus los estaba llevando a casa. El Doctor, Clara y los tres científicos restantes volaron en el trineo sobre Londres y uno a uno todos fueron siendo devueltos a sus propios tiempos y lugares, aunque Clara fue la excepción.
Despertando donde había estado antes del ataque inicial, el Doctor viajó a la casa de Clara y removió el cangrejo del sueño que continuaba aferrado a su cabeza, aunque al hacerlo descubrió que Clara era ya una anciana, pues habían pasado sesenta y dos años desde los eventos en la base. Clara le contó al Doctor todo lo que había soñado en esos años, pero el Doctor se sentía culpable por haberla dejado sola tanto tiempo. De pronto, Santa Claus apareció y le preguntó al Doctor qué es lo que haría si tuviese una segunda oportunidad, y el Doctor despertó nuevamente en el lugar donde se encontraba previo al ataque, aunque esta vez sí había despertado completamente. Volvió a viajar a donde Clara y le quitó el cangrejo de su rostro. Esta vez Clara era joven de nuevo. Aún un poco culpable por lo que casi le sucede a su acompañante, el Doctor la invitó a continuar viajando con él, cosa que ella aceptó alegremente. Corrieron hasta la TARDIS y viajaron. (TV: Last Christmas)
Segunda oportunidad con Clara
Descubriendo que un grupo de alienígenas planean convertir un planeta de hipopótamos antropomórficos rosas en piedra, el Doctor decidió intervenir en una fase temprana de su invasión y se los llevó hacia el antiguo Egipto, donde petrificaron a un enorme alienígena con forma de gato, creando la Esfinge y quedando aplastados en el proceso. Él y Clara regresaron al planeta de los hipopótamos para revertir el efecto petrificador. (CÓMIC: Petrified)
El Doctor y Clara hicieron que la tripulación del capitán Ratlett se pusiese en su contra y les enseñaron una vida mejor. (CÓMIC: The Wheelers) Posteriormente, estuvieron a punto de ser consumidos por plátanos robóticos por robar comida de la Luna Schlosser, (COMIC: Five a Day) y salvaron la Ciudad de las Nubes de Mirmi 24 antes de que fuese comida por una serpiente alienígena. (CÓMIC: The Very Hungry Snake)
El Doctor intentó llevar a Clara a Blackpool, pero acabaron aterrizando en el año 2089, momento en que la placentera playa se había convertido en una jungla muy densa. El Doctor se hizo amigo y dio un nombre a Meghan, un burro herido que había sido disparado por un hombre llamado Triss, que había planeado un viaje de caza en cápsulas flotantes energizadas por la Torre de Blackpool. El Doctor apagó la energía, poniendo fin a los planes de caza de Triss. Luego, bailó con Clara en un salón de baile. (PROSE: All the Empty Towers)
Escondiéndose de Davros
Mientras buscaba una biblioteca, el Doctor acabó aterrizando en un campo de batalla durante la Guerra de los Mil Años en Skaro, donde se encontró a un niño atrapado en medio de múltiples minas de mano. Al tratar de rescatarlo, descubrió que el niño era Davros. En el momento en que debería haber sido "lo suficientemente valiente y fuerte para hacer algo mejor", el Doctor se marchó del campo de batalla, sin querer salvar ni matar al niño que acabaría creando a los Daleks. Posteriormente, el anciano Davros, que se encontraba "muy enfermo", quiso ver al Doctor. (TV: The Doctor's Meditation, The Magician's Apprentice)
Colonia Sarff recibió la orden de buscar al Doctor y empezó a hacerlo, momento en que el Doctor acudió al planeta Karn y se reunió con Ohila y la Hermandad de Karn. Tras esconderse de Colonia Sarff detrás de una roca, (TV: The Magician's Apprentice) el Doctor habló con Ohila, que le dijo que no le debía nada a "esa criatura" y no debería acudir a una confrontación, ya que aquello acabaría siendo su fin. El Doctor entregó a Ohila su disco de confesión y dijo que iba a encontrar una roca para ir a meditar, preparándose para su posible destrucción. (WC: Prologue)
El Doctor viajó hacia Essex en 1138, (TV: The Magician's Apprentice) donde obtuvo a un sirviente, Bors, tras ayudarlo a que se quitara una astilla. Después de tres horas de meditación en un castillo, el Doctor decidió que necesitaba agua de mejor calidad, de modo que reunió a los locales para que cavasen un nuevo pozo. Tras once días cavando agujeros en busca de agua y un día más para construir el pozo, el Doctor, en vez de continuar con la meditación, decidió realizar mejoras en el castillo, (TV: The Doctor's Meditation) construyendo un centro de visitantes de primera clase y bueno para los niños, enseñando matemáticas a los locales e introduciendo la palabra "Tío" en el siglo XII. (TV: The Magician's Apprentice)
Cinco días después, el Doctor empezó a practicar trucos de magia y tuvo una conversación con Bors, que notó que estaba evitando la meditación. Otros cuatro días pasaron y el Doctor finalmente decidió empezar a meditar otra vez antes de marcharse al día siguiente, comentando con Bors la razón por la que estaba siendo tan reservado. (TV: The Doctor's Meditation)
En su último día en el castillo, el Doctor fue retado a una pelea con hachas con Bors, pero apareció encima de un tanque tocando una guitarra eléctrica. Según trataba de hacer que la multitud entendiera sus chistes, se dio cuenta de que Clara y Missy estaban en el castillo. Colonia Sarff apareció para demandar que el Doctor acudiese a ver a Davros y él aceptó, siendo transportado como prisionero junto con Clara y Missy, que insistieron en ir junto con él.
Sarff llevó a los tres a un hospital de Skaro en el que se encontraba Davros, que estaba al borde de la muerte. Mientras Clara y Missy se quedaron en una celda, el Doctor fue llevado ante Davros, que reveló al Doctor que había recordado el encuentro que tuvo con él cuando era un niño y el hecho de que el Doctor se negara a salvarlo. El Doctor vio desde una pantalla que Clara y Missy salieron de su celda y fueron capturadas por los Daleks, que además habían conseguido apoderarse de la TARDIS. Missy fue aparentemente exterminada tras intentar convencer a los Daleks para que trabajasen junto con ella; el Doctor rogó a Davros que perdonara a Clara, pero él dijo que no tenía ningún control sobre los Daleks. El Doctor vio a Clara ser aparentemente exterminada y también vio la presunta destrucción de la TARDIS. (TV: The Magician's Apprentice)
Davros se burló de la compasión del Doctor, diciendo que ese fue el motivo de su derrota. El Doctor gritó a Davros para que saliera de su silla y se la quitó por la fuerza, sentándose en ella y desplazándose hacia la zona de los Daleks. Se burló de ellos cuando fueron incapaces de dispararlo y pidió que le informasen acerca de lo ocurrido con Clara, amenazándolos para que se atreviesen a responder. No obstante, el Doctor fue atacado por las serpientes de Colonia Sarff y llevado de vuelta a la sala de Davros, donde ambos tuvieron una conversación acerca del poder de los Daleks y Davros trató de convencer al Doctor para que tocase los cables del medio de la sala para poder tener control total sobre los Daleks. Davros luego le pidió que se acercara para verlo con sus ojos reales y el Doctor quiso cumplir su último deseo y permitir que contemplase el amanecer en Skaro. Para ello, intentó dar algo de energía regenerativa a Davros, pero cayó en su trampa: Colonia Sarff lo atrapó y la energía fue difundida por todos los Daleks de Skaro.
El Doctor fue salvado por Missy y reveló que no solo sabía acerca de los planes de Davros, sino que llevó a cabo su propia trampa: la energía regenerativa también se difundió por el alcantarillado de Skaro y los Daleks en descomposición empezaron a atacar, afectando a los otros Daleks y provocando la destrucción de la Ciudad Dalek. El Doctor y Missy salieron de la sala y se encontraron con un Dalek que no estaba siendo afectado. El Doctor le preguntó dónde estaba Clara, pero el Dalek estuvo repitiendo la frase "Soy un Dalek" una y otra vez. Missy intentó hacer que el Doctor eliminara al Dalek, pero cuando el Doctor vio que estaba pidiendo misericordia, ayudó a que abriese su armadura y descubrió que era Clara quien estaba en el interior. El Doctor fue con Clara hacia la zona de los Daleks y utilizó sus gafas de sol sónicas para rematerializar la TARDIS a su alrededor, logrando escapar.
Según él y Clara veían a la Ciudad Dalek derrumbarse, el Doctor se dio cuenta de que el Dalek en el que estaba Clara solo pudo pedir misericordia debido a un motivo: tenía que salvar al pequeño Davros para que introdujese el concepto de misericordia en los Daleks. Armado con un brazo Dalek, el Doctor regresó al campo de batalla y eliminó a todas las minas de mano que rodeaban a Davros. Acto seguido, dijo a Davros que no importaba que uno fuese amigo o enemigo siempre y cuando hubiese misericordia y lo cogió de la mano para ayudarlo a salir de aquél lugar. (TV: The Witch's Familiar)
Fantasmas en The Drum
El Doctor y Clara continuaron sus aventuras juntos, llegando a visitar un lugar en el que personas con cuellos largos celebraban la Nochevieja a lo largo de dos siglos.
La TARDIS los llevó hacia The Drum, una base submarina del año 2119 situada en un pueblo inundado. Los dos se desplazaron por la base sin encontrar a nadie y vieron que allí hubo algún tipo de conflicto. De repente, vieron aparecer a un Tivolian y a un hombre con un aspecto fantasmagórico y se encontraron a una nave espacial con marcas en un idioma desconocido que la TARDIS no pudo traducir. Los dos individuos que habían aparecido persiguieron al Doctor y a Clara, que huyeron hacia una jaula de Faraday en la que estaba la tripulación de la base.
La tripulación explicó que el hombre al que habían visto era uno de los miembros de la tripulación, pero falleció y empezó a aparecer junto con el Tivolian por las noches. El Doctor dedujo que eran fantasmas y llevó a cabo un plan junto con la tripulación para atrapar a los fantasmas en la jaula. Al hacer esto, descubrieron que los fantasmas estaban repitiendo una y otra vez las coordenadas de una ubicación: la iglesia del pueblo inundado. Investigando la zona, encontraron la cápsula de estasis de la nave espacial que estaba en la base, aunque estaba bloqueada. El Doctor notó que las coordenadas eran los símbolos que estaban marcados dentro de la nave y decidió viajar hacia el pasado para visitar la ciudad antes de la inundación y descubrir la verdad. Según el Doctor y los demás se dirigían hacia la TARDIS, los fantasmas empezaron a provocar una inundación en la base, provocando que las puertas de emergencia se cerrasen. El grupo fue separado por la mitad: Clara se quedó en la base con Cass y Lunn, mientras que el Doctor, O'Donnell y Bennett se desplazaron en la TARDIS. (TV: Under the Lake)
Aterrizando en 1980, el Doctor, O'Donnell y Bennett encontraron al Tivolian Albar Prentis, que todavía estaba vivo y se disponía a utilizar la nave espacial (que aún no tenía las marcas en su interior) para transportar a un señor de la guerra fallecido conocido como el Rey Pescador. Contactando con Clara, el Doctor descubrió que un fantasma de si mismo había aparecido en 2119 y estaba pronunciando los nombres de todos en un orden específico. El Doctor se quedó perturbado ante la idea de que moriría y Clara le pidió que cambiase los hechos, aunque él mismo insistió en que tendría que morir. El Rey Pescador revivió y asesinó a Prentis, procediendo a buscar a los demás. O'Donnell también falleció a sus manos, momento en el que Bennett notó que el orden de los nombres pronunciados por los fantasmas era el orden en que todos morirían. El Doctor y Bennett intentaron regresar al futuro, ya que Clara era aparentemente la siguiente persona en morir, pero en vez de eso, la TARDIS los envió treinta minutos hacia atrás en el pasado.
El Doctor envió a Bennett de vuelta al futuro con el Protocolo de Seguridad 712 y preparó la destrucción de la presa cercana al pueblo antes de confrontar al Rey Pescador. El Rey Pescador dijo al Doctor que los fantasmas estaban transmitiendo señales para que su especie acudiese a rescatarlo. El Doctor mintió diciendo que había eliminado las marcas del interior de la nave, engañándolo para conseguir que regresara a la nave. El Doctor accedió a la cámara de estasis de la nave para protegerse y la presa se destruyó antes de que el Rey Pescador pudiese entrar. El pueblo quedó completamente inundado y el Rey Pescador se ahogó.
139 años después, el Doctor se despertó de vuelta en la base submarina, revelando a Clara y a los demás que su fantasma tan solo era una proyección. Él y los demás supervivientes engañaron a los fantasmas para que fuesen de vuelta a la jaula de Faraday. Acto seguido, el Doctor eliminó las marcas de la nave de las memorias de todos y les dijo que UNIT iba a deshacerse de los fantasmas. A punto de marcharse con Clara en la TARDIS, el Doctor comentó que tan sabía el orden de nombres que su proyección tenía que pronunciar porque ella se lo había dicho antes - siendo esto una paradoja ontológica. (TV: Before the Flood)
Lidiando con una inmortal
Luego de rescatar a Clara de quedar flotando en el espacio, el Doctor aterrizó la TARDIS en el planeta Tierra, en la época vikinga. El Doctor y Clara son capturados por vikingos, uno de los cuales rompió las gafas de sol sónicas del Doctor antes de llevarlo a su aldea. El Doctor intentó hacerse pasar por Odín, para que lo liberasen, aunque justo en ese momento el rostro de alguien que sí se parecía a Odín apareció en el cielo e invitó a los mejores guerreros a un festín. Varios Mire aparecieron y llevaron a los guerreros a la nave, junto a Clara y a una niña vikinga llamada Ashildr, pues estaban usando las gafas de sol sónicas.
A bordo de la nave espacial de los Mire, Ashildr declaró la guerra entre su aldea y los alienígenas, luego de que estos asesinasen a todos los guerreros que habían llevado a la nave. El Doctor intentó convencer a los aldeanos de dejar el lugar, pero ellos prefirieron morir con honor en batalla antes que huir. Clara convenció al Doctor de entrenar a los aldeanos, y él aceptó. Sin embargo, ya que la mayoría de los aldeanos restantes eran pescadores y granjeros, no tenían la más mínima habilidad, y les fue muy difícil aprender, incluso lo básico. Finalmente, al darse cuenta de lo que significaba "fuego en el agua", lo cual había oído decir a un bebé, se dio cuenta de que habían anguilas eléctricas, con las cuales decidió hacer un plan.
Cuando Odín y los Mire llegaron al día siguiente, el Doctor los distrajo con una fiesta en un granero. Los aldeanos usaron las anguilas para electrocutar a los robots, y el Doctor le dio uno de los cascos de los Mire a Ashildr, quien lo usó para proyectar la imagen de un dragón en las mentes de los Mire, asustándolos y haciendo que huyan, dejando solo a Odín. Finalmente, resultó que el dragón no era más que un gran títere. El Doctor reveló que Clara había grabado lo sucedido, y amenazó con publicar el vídeo si no abandonaban el lugar pacíficamente, arruinando su reputación. Los Mire dejaron el lugar, pero las celebraciones cesaron de inmediato cuando se dieron cuenta de que Ashildr había muerto a consecuencia de haber usado el casco.
El Doctor y Clara se reunieron en el granero de las anguilas, donde conversaron, mientras el Doctor se lamentaba no poder salvar a todos. No obstante, al ver su reflejo en el agua, se dio cuenta de que su encarnación actual tenía el mismo rostro que Lobus Caecilius, a quien había salvado de una muerte fija en el tiempo durante su décima encarnación. Su nuevo rostro era un recordatorio para siempre intentar salvar gente, sin importar las limitaciones. Usando un chip médico que extrajo del casco de los Mire, trajo a Ashildr de vuelta a la vida, dejándole un segundo chip para que use por si algún día quería compartir la inmortalidad con alguien. El Doctor se dio cuenta que al haber hecho esto, había convertido a Ashildr en un híbrido. (TV: The Girl Who Died)
El Doctor ayudó a Evie Hubbard, estudiante del séptimo año de Coal Hill School, con su tarea, permitiéndole tener una entrevista con Winston Churchill. (TV: The Woman Who Lived)
En algún momento luego de dejar Escandinavia, mientras Clara llevaba a sus alumnos de séptimo grado a sus clases de artes marciales, el Doctor observó a Ashildr viviendo entre un grupo de leprosos para ayudar a los enfermos, pero decidió no anunciar su presencia.
El Doctor rastreó un artefacto alienígena, el Ojo de Hades en 1651, en Inglaterra, donde un atracador de caminos llamado la Pesadilla estaba asaltando un carruaje. La intervención del Doctor resultó en que el carruaje lograse escapar antes de que pudiesen conseguir el artefacto, pues ambos estaban tras el mismo objeto. La Pesadilla resultó ser Ashildr disfrazada, quien había olvidado su identidad luego de haber vivido muchos años. Ashildr le pidió al Doctor que la lleve en la TARDIS, pero él no aceptó. Ambos formaron un equipo para robar el artefacto de la mansión Fanshawe. El Doctor dedujo que el artefacto tenía la capacidad de abrir portales en el espacio. Luego descubrió que Ashildr tenía un aliado llamado Leandro, quien era el dueño original del artefacto, pero necesitaba la muerte de alguien para activarlo. Al descubrir que otro atracador de caminos, Sam Swift, iba a ser ejecutados, decidieron aprovechar la oportunidad para activar el Ojo de Hades, dejando al Doctor atado en la mansión de Ashildr.
Logrando persuadir a los guardias de dejarlo ir, el Doctor llegó al lugar de la ejecución, y logró evitarla, usando su papel psíquico. Sim embargo, Ashildr colocó el artefacto en el pecho de Swift, asesinándolo y abriendo el portal. Leandro reveló que solo había usado a Ashildr para abrir el portal y permitir que su raza pudiese invadir la Tierra. Al darse cuenta de su error, Ashildr usó el segundo kit médico Mire en Sam Swift, revirtiendo el proceso ocasionado por el Ojo de Hades, y cerrando el portal. Más tarde, Ashildr aceptó el hecho de que el Doctor no quisiese viajar con ella, y le dijo que cuidaría a las personas que él dejase atrás, y ambos partieron en rumbos distintos en buenos términos.
Cuando el Doctor recogió a Clara más tarde, ella le mostró una foto de una estudiante a la que él había ayudado en un proyecto, y el Doctor se sorprendió al ver a Ashildr en el fondo de la imagen. Sin darle mayor importancia, ni contándole a Clara que había visto a Ashildr en la foto, ambos decidieron seguir buscando nuevas aventuras. (TV: The Woman Who Lived)
Levantamiento Zygon
Al volver a la Tierra del siglo XXI, el Doctor descubrió que el cese al fuego entre humanos y Zygons se había roto, y que los líderes del alto comando Zygon habían sido derrocados por una facción radical rebelde en Turmezistan. Una versión que sobrevivió de Osgood fue secuestrada por los Zygons, y Kate Stewart explicó que desde el alto al fuego, habían convivido dos Osgoods, una de las cuales fue asesinada por Missy. Luego de volver a recibir el título de presidente de la Tierra, el Doctor perdió a un grupo de soldados de UNIT en Turmezistan, cuando estos fueron engañados y asesinados por el grupo radical de Zygons.
El Doctor logró rescatar a Osgood de la base rebelde. La llevó a ella y a un Zygon que capturaron al avión presidencial. Mientras el avión volvía al Reino Unido, un Zygon llamado Bonnie llamó al Doctor usando la voz y el celular de Clara, para informarle que tanto Clara como Kate habían sido asesinadas, y lanzó un misil contra el avión del Doctor y Osgood. (TV: The Zygon Invasion)
Bonnie falló su primer disparo, lo cual les dio tiempo justo para poder saltar en paracaídas del avión, antes de que un segundo misil lo destruyese. Aterrizaron de forma segura y lograron volver a Londres. Se reunieron con Kate en una tienda, luego de presenciar el suicidio de un Zygon aterrorizado. Dentro del Archivo Negro de UNIT, Bonnie descubrió que el Doctor había colocado dos Cajas de Osgood en lugar de una sola, como salvaguarda de la paz entre humanos y Zygons. Bonnie exigió que el Doctor sea llevado allí. Supuestamente una caja tenía la posibilidad de revertir a los Zygons a sus formas originales y la otra liberaría un gas que acabaría con ellos.
Cuando Bonnie y Kate intentaron usar las cajas, el Doctor logró persuadirlas de no hacerlo, usando sus propias memorias y experiencias de la Última Gran Guerra del Tiempo. Decidieron no usar las cajas, y Bonnie dedujo que en realidad solo eran botones, ya que las cajas no tenían nada dentro. El Doctor luego borró la memoria de Kate y de los Zygons guardias, pero permitió que Bonnie recordase lo ocurrido para permitir que la paz se mantenga. Mientras el Doctor y Clara se preparaban para irse, el Doctor reiteró la invitación a Osgood para que viaje con él, pero ella no aceptó la oferta, pues quería seguir ayudando a mantener la paz. Bonnie tomó la forma de Osgood, y se comprometió a ayudarla a propiciar el cese al fuego. El Doctor quiso saber si ambas Osgoods eran Zygons o si una era la Osgood original, aunque ambas se negaron a decirle, admitiendo que se lo revelarían el día en el que la respuesta no importe. (TV: The Zygon Inversion)
Aventuras finales con Clara
El Doctor y Clara aterrizaron en una estación espacial llamada Le Verrier en el siglo XXXVIII, donde Gagan Rassmussen, el creador de las vainas Morpheus, utilizó sus inventos para crear un vídeo dramático de una aventura. En este vídeo encriptó un mensaje que crearía más Sandmen a partir de lagañas en los ojos de los humanos que lo vean, luego de alterar la química cerebral.
El Doctor y Clara se unieron a un grupo de rescatistas, quienes buscaban a Rassmussen. Finalmente, el equipo perdió a Rassmussen, y solo quedaron el Doctor, Clara y la comandante Nagata. El Doctor descubrió que las lagañas en los ojos de aquellos que hubiesen usado las vainas Morpheus, o aquellas que flotasen en el aire, estaban siendo usadas como cámaras. Nagata aparentemente asesinó a Rassmussen cuando él intentó hacer que los Sandmen se difundan a otros planetas y lunas, por lo que el Doctor se vio obligado a destruir la estación espacial, apagando sus escudos gravitacionales. El Doctor, Clara y Nagata evacuaron el lugar en la TARDIS, con la intención de destruir todas las vainas Morpheus en el universo para evitar que se sigan creando más Sandmen. No obstante, el Doctor quedó confundido por los cabos sueltos y la curiosa forma como los últimos eventos se habían llegado, como si hubiesen sido preparados intencionalmente. (TV: Sleep No More)
La llegada del Híbrido
Rigsy llamó al teléfono de la TARDIS, luego de que Clara le diese el número tras haberlos ayudado a lidiar con los sinhuesos. Esto llevó a que el Doctor y Clara descubriesen que Rigsy había perdido parcialmente la memoria de lo que le había ocurrido el día anterior, y que ahora tenía un misterioso tatuaje en el cuello, el cual era también una cuenta regresiva al momento de su muerte. La investigación llevó al grupo a una calle trampa, donde una sociedad alienígena coexistía en la Tierra, sin que los humanos se enterasen. El grupo fue recibido por la Alcaldesa Yo, quien les informó que Rigsy había asesinado a una de las residentes, Anah, y que por eso moriría, a manera de castigo.
Sin que el Doctor lo supiese, Clara tomó el chronolock de Rigsy. Finalmente, cuando se reveló que todo había sido una trampa para conseguir atraer al Doctor, para enviarlo a otro lugar, Ashildr intentó quitarle el chronolock a Rigsy, aunque no pudo hacerlo, porque ahora lo tenía Clara, y era irremovible. Muy molesto, el Doctor amenazó a Ashildr con destruir su calle de refugiados, a menos que salvase a Clara. El deseo final de Clara fue que el Doctor no se vengase por lo ocurrido - "sé un Doctor, nunca un guerrero". El Doctor luego observó a Clara morir. Ashildr intentó disculparse por la muerte de Clara, diciendo que eso nunca fue parte del plan. El Doctor le recomendó que se aparte de él, pese a la promesa que le hizo a Clara, pues podía ser un "universo muy pequeño" cuando él está molesto con alguien. El brazalete transportador se activó en ese momento, llevando al Doctor a su nuevo destino. (TV: Face the Raven)
Llegando a un puerto de teletransportación en la parte superior de una torre dentro de su disco de confesión, el Doctor fue perseguido por el Velo, una criatura tomada de las pesadillas del Doctor. En un determinado momento, el Doctor llegó a una pared de azbantio sólido dentro de una habitación con el número 12. Mientras le confesaba al Velo que temía morir y que estaba asustado de la profecía del "Híbrido", el Doctor se negó a decir quién era el Híbrido, y en lugar de hacerlo, se dedicó a intentar romper la pared con sus puños, mientras le contaba al velo la historia del pastor de los hermanos Grimm.
Muy herido como para poder regenerarse, el Doctor se arrastró a la cima de la torre adonde fue teletransportado antes, y quemó su propio cuerpo para darle energía a la máquina y lograr cargar una copia de sí mismo en el momento en el que llegó al lugar. El Doctor repitió este ciclo por cuatro mil millones y medio de años. Finalmente, entre las múltiples copias del Doctor lograron romper la pared y la más reciente atravesó un portal que lo condujo a Gallifrey. Luego de pedirle a un niño que se encontraba por allí que le informe a alguien importante que había llegado. Luego dijo, dirigiéndose al disco de confesión, que no habían entendido la profecía correctamente - "El Híbrido, destinado a conquistar Gallifrey y pararse sobre su ruina, soy Yo." (TV: Heaven Sent)
El Doctor logró llegar al granero donde dormía cuando era un niño, en el cual casi detonó al Momento. Examinando la cama en la que solía dormir, fue encontrado y reconocido por una mujer, quien le dio sopa, la cual comió mientras era observado por varios Señores del Tiempo sorprendidos. El Doctor se negó a hablar con cualquier persona hasta que Rassilon en persona llegase al lugar a hablar con él. El Doctor le dijo simplemente "vete de mi planeta", y se negó a escuchar lo que Rassilon quería decir. Rassilon ordenó que el pelotón de fusilamiento disparase contra el Doctor, pero ellos se negaron, por respeto. El Doctor llamó refuerzos usando sus gafas de sol sónicas, y Rassilon se vio obligado a rendirse, dejando al Doctor como Señor Presidente de Gallifrey. Expulsó a Rassilon del planeta, culpándolo por los horrores de la guerra. El General explicó que Gallifrey había sido llevada al fin del universo, aproximadamente.
Al bajar a los Claustros, el Doctor se reunió con Ohila, quien le explicó que Rassilon estaba buscando información acerca del Híbrido. En la cámara del consejo, se reunieron con el resto de la Hermandad de Karn y el General. En ese momento, el Doctor anunció que podía protegerlos del Híbrido, pero para ello necesitaría la ayuda de Clara Oswald. El Doctor y el General fueron entonces a la cámara de extracción 7, para extraer a Clara de su línea temporal en el momento previo a su muerte, de esta forma también paralizando sus funciones vitales. En ese momento el Doctor le quitó su arma al General, y amenazando con disparar contra todos en el lugar, consiguió que uno de los trabajadores del lugar le diese un bloqueo neural calibrado para humanos, justo antes de dispararle al General, quien se regeneró, mientras el Doctor y Clara huían.
Atravesando los Claustros, el Doctor y Clara se encontraron con un Dalek prisionero, un Cyberman y un grupo de ángeles llorosos. hasta que el Doctor descubrió un pasaje secreto cerca al elevador 7, y le dijo que él había hallado este mismo pasaje cuando fue un niño, mientras se negaba a dar detalles acerca del tiempo que pasó en el dial de confesión. Clara logró enterarse del tiempo que el Doctor pasó allí de parte de Ohila, mientras que en realidad estaba creando una distracción para que el Doctor pudiese escapar hacia el taller de mantenimiento debajo de los Claustros, donde robó una TARDIS, para recoger a Clara de los Claustros y huir de Gallifrey.
Con Clara aún congelada, el Doctor la llevó a los últimos minutos del universo, creyendo que el tiempo podría sanarla y volvería a estar técnicamente viva. Esto no ocurrió, y en lugar de esto, oyeron un golpe en la puerta de la TARDIS, resultando que era Ashildr, quien seguía viva hasta aquel momento. El Doctor salió de la TARDIS, dejando a Clara dentro, e intercambió teorías respecto al Híbrido con Ashildr. Él creía que Ashildr era el Híbrido, mientras que ella pensaba que el Híbrido era el Doctor mismo, o las fuerzas combinadas del Doctor y Clara.
Negando las teorías de Ashildr, el Doctor le contó acerca de su plan para borrarle la memoria a Clara para protegerla de los Señores del Tiempo, aunque sin que ellos lo sepan, Clara había espiado su conversación, y había revertido la polaridad del bloqueo neural con las gafas de sol sónicas. Al descubrir lo que Clara había hecho, el Doctor aún estaba decidido a usar el dispositivo, el cual acabó haciendo efecto en él, haciendo que pierda sus recuerdos de Clara y perdiese el conocimiento por un momento.
Eventualmente el Doctor se levantó en el desierto de Nevada, donde un hombre le dijo que Clara le había pedido que cuide de él. Habiendo olvidado el rostro de Clara, pero aún manteniendo recuerdos vagos del tiempo que pasaron juntos, el Doctor llegó a un restaurante en el desierto, donde Clara era la camarera. El Doctor le contó a Clara, sin saber quién era, su historia mientras tocaba una canción compuesta para Clara en su guitarra eléctrica. Habiendo acabado de hablar, la camarera se fue por una puerta, y el restaurante entero se desmaterializó, revelándose que se trataba de la TARDIS robada. Estando nuevamente en el desierto, el Doctor encontró su propia TARDIS, con el mural dedicado a Clara hecho por Rigsy aún en la parte exterior de ésta. Recibiendo un nuevo destornillador sónico de la TARDIS, el Doctor dejó el desierto en busca de nuevas aventuras, y mientras la TARDIS se desmaterializaba, el mural se desvaneció. (TV: Hell Bent)
Viajando a solas
El Doctor estuvo en una escuela vacía hacia el período navideño de 2115 y conoció a Ross McNamara, a quien supuestamente perseguía un fantasma. Investigando, el Doctor descubrió que una nave Helestician estaba en el sótano y que había enviado a Ross adelante en el tiempo desde 2015, siendo el fantasma un eco de Ross creado por el viaje temporal. Tras hacer explotar la escuela para liberar la nave, el Doctor llevó a Ross de vuelta a casa. (PROSA: Haunted)
El Doctor recibió una llamada de Osgood pidiéndole que acudiera a Londres para ayudar con un "gran problema". UNIT había recreado el robot K1 bajo órdenes del gobierno británico, pero este escapó y estaba sembrando el caos en el centro de Londres. El Doctor recogió a Osgood con la TARDIS y se desplazó al río Támesis, donde K2 estaba destrozando el London Eye. El Doctor usó la configuración roja de su destornillador sónico para desactivar al robot, salvando Londres una vez más. (CÓMIC: Robo Rampage)
El Doctor visitó el planeta Rhodia, cuya población de tres billones de personas estaba siendo aniquilada por los Shadow Kin, quienes surgieron durante la guerra civil que estaba teniendo lugar entre las dos facciones opuestas de Rhodia. El Doctor tan solo pudo recoger a dos supervivientes: el príncipe Rhodiano y la terrorista obligada a proteger al príncipe como castigo por sus crímenes. Para protegerlos, el Doctor se los llevó a la Tierra, específicamente en Shoreditch, Londres, donde ambos obtuvieron nuevas identidades: Charlie Smith, un estudiante de Coal Hill Academy; y Andrea Quill, profesora en el mismo lugar.
Cuando los Shadow Kin encontraron a Charlie y a Quill en Coal Hill Academy, Quill llamó al Doctor para pedir ayuda y él regresó. Confrontando al rey de los Shadow Kin, Corakinus, el Doctor aprovechó su debilidad ante la luz y la utilizó para hacerlos retroceder por la grieta espacio-temporal por la que se habían desplazado, sellando la grieta justo después. Sabiendo que grietas como aquella continuarían apareciendo por la escuela debido al exceso de energía Artron en la zona, el Doctor confió en que Quill y Charlie defenderían el lugar ante todo tipo de amenazas junto con los compañeros de Charlie que habían confrontado al Shadow King con él.
Antes de irse, el Doctor llevó a la TARDIS a Ram Singh, estudiante cuya pierna derecha había sido cortada por Corakinus, para curarlo y darle una pierna protésica Lothan que reemplazaría a la original. El Doctor reaccionó al ver el nombre de Clara en una pared conmemorativa en honor del personal y los estudiantes de Coal Hill que habían fallecido, aunque se desconoce si esto afectó su memoria de ella o no. (TV: For Tonight We Might Die)
El Doctor se fue a Nueva York en los años 1990 para deshacer el daño de ciertas paradojas temporales de las que tenía cierta responsabilidad. Allí, preparó una trampa para impedir que otros interfiriesen con su trabajo, aunque él mismo fue víctima de su propia trampa; esto lo llevó a conocer a Grant, un niño al que le encantaban los cómics que le dio el apodo de "Doctor Mysterio", nombre al Doctor le agradó. El Doctor permitió a Grant ayudarlo, dándole la gema Hazandra que necesitaba para dar energía a su dispositivo. No obstante, Grant lo confundió con la medicina para resfriados que necesitaba y se tragó la gema; como esta gema otorgaba deseos, Grant obtuvo superpoderes. El Doctor hizo que Grant prometiese no usar sus poderes nunca para no corromperse y vigiló a Grant durante los años posteriores. (TV: The Return of Doctor Mysterio)
Reuniéndose con River Song
Mientras se relajaba en su TARDIS en Mendorax Dellora el día de Navidad de 5343, el Doctor fue encontrado por Nardole, que lo confundió con un cirujano al que estaba buscando. Nardole se lo llevó hacia River Song, que fue incapaz de reconocer al Doctor ya que no sabía nada acerca de su nuevo ciclo de regeneraciones. El rey Hydroflax, con quien River se había casado, necesitaba una operación para que se le extrajera el diamante Halassi Androvar de su cabeza; no obstante, lo que River planeaba en realidad era quitarle la cabeza a Hydroflax para recuperar el diamante.
Hydroflax averiguó lo que planeaba River y trató de matar a ella y al Doctor, aunque ellos vieron que la cabeza de Hydroflax ya estaba separada de su cuerpo robótico autónomo y consiguieron cogerla para defenderse, ya que el cuerpo no actuaría por riesgo de dañar la cabeza de Hydroflax. El Doctor y River fueron teletransportados hacia el exterior por Ramone, que resultó ser otro marido de River. Ella y Ramone revelaron que estaban buscando al Doctor y él trató de explicar que estaba allí mismo con ellos, aunque River seguía sin entenderlo. River decidió "tomar prestada" la TARDIS para huir del cuerpo de Hydroflax, pero la TARDIS no podía desmaterializarse con la cabeza de Hydroflax dentro y su cuerpo fuera al mismo tiempo. Cuando el cuerpo se apoderó de la cabeza de Ramone para conseguir entrar en la TARDIS, el Doctor se encargó de cerrar las puertas y la TARDIS por fin salió de Mendorax Dellora.
La TARDIS aterrizó en el crucero espacial Harmony and Redemption, donde River reveló que iba a vender el diamante a alguien llamado Scratch, aunque luego descubrió que tanto él como los demás a su alrededor eran seguidores acérrimos del rey Hydroflax. River y el Doctor trataron de huir con la cabeza de Hydroflax, pero su cuerpo los encontró y acabó vaporizando a su propia cabeza tras determinar que su estado ya no iba a mejorar. El cuerpo quiso la cabeza del Doctor para reemplazar a la de Hydroflax y River fue cuestionada por su relación de amor con él, aunque ella afirmó que no creía que él la amase o fuese capaz de amar a alguien siquiera. El Doctor finalmente hizo a River entender que él era el Doctor y había estado con ella todo el tiempo y los dos aprovecharon una tormenta de meteoritos para escapar. Ambos intentaron salvar al Harmony and Redemption de una colisión en Darillium, pero fueron incapaces y regresaron a la TARDIS para protegerse del impacto.
El Doctor recobró la conciencia antes que River y, sabiendo que tendría su última cita con River en Darillium, decidió finalmente llevar a cabo este suceso. En el lugar de la colisión del crucero, entregó el diamante a un hombre y sugirió que construyese un restaurante con vistas a las famosas Torres Cantantes de Darillium. Luego, viajó hacia el futuro en la TARDIS con el lujoso restaurante ya creado y reservó una mesa junto al balcón para cuatro años después. Tras otro viaje hacia el futuro, él esperó a que River recobrara la consciencia y apareció ante ella en el restaurante con una vestimenta formal y habiéndose cortado el pelo. El Doctor le regaló un destornillador sónico y los dos tuvieron una triste conversación cuando River mencionó los rumores de que aquella fuese su última noche juntos. No obstante, River se alegró cuando el Doctor le dijo que las noches en Darillium duraban 24 años. (TV: The Husbands of River Song)
Fiel a su palabra, el Doctor se quedó con River en Darillium durante veinticuatro años. En este período, el Doctor recuperó a Nardole del cuerpo de Hydroflax (TV: The Return of Doctor Mysterio) y reconstruyó su cuerpo usando partes humanas en algunos lugares. (TV: The Pyramid at the End of the World)
St Luke's University
Cuando se fue de Darillium, el Doctor fue solicitado por una especie desconocida para que acudiese a un planeta para actuar como el ejecutor de Missy. Nardole lo siguió hacia allí siguiendo la última petición de River y lo convenció para que perdonara a Missy, aunque el Doctor había hecho el juramento de vigilarla a lo largo de mil años mientras ella estaba encerrada en una cámara de cierre cuántico. (TV: Extremis) El Doctor y Nardole llevaron la cámara a St Luke's University en el siglo XX. (TV: The Pilot) Debido a su promesa, el Doctor no podía salir del mundo a no ser que fuese por una emergencia; (TV: Smile) durante este período, empezó a dar clases en la universidad. (TV: The Pilot) Nardole se quedó con él para asegurar que cumplía con su juramento, (TV: Smile) instrucciones que le dio el propio Doctor. (TV: Oxygen)
El Doctor descubrió que la Armonía Invernal había invadido las ciudades capitales de la Tierra y se esforzó por impedir que se implantasen en las cabezas de los líderes del mundo. Esto le llevó a conocer al Grant adulto, quien ahora actuaba como el justiciero llamado el Fantasma. Juntos, consiguieron acabar con la Armonía Invernal a base de destruir su nave espacial antes de que se colisionara contra la Tierra y la destruyese. (TV: The Return of Doctor Mysterio)
Cuando los Vigilantes Eremitas de Andurax necesitaban la gema Hazandra para abrir una grieta hacia la Infra Puerta de Tersimmon, el Doctor regresó a Grant, siendo esto ocho años después desde la perspectiva de Grant para que encontrasen las otras gemas juntos. Grant tan solo accedió a ayudar si Lucy y Jennifer pudiesen ir con él. (CÓMIC: Ghost Stories)
Primeros viajes con Bill
Hacia 2016, (TV: Knock Knock) el Doctor empezó a prestar atención a una empleada de la cafetería de la universidad, Bill Potts, quien estaba atendiendo a sus clases; viendo como a Bill le fascinaba lo desconocido, se convirtió en su tutor personal. Bill se encontraba con el Doctor cada día a las 6 de la tarde para clases privadas y sacaba buenas notas continuamente durante el año académico. Para agradecerlo, Bill dio al Doctor una alfombra por Navidad, gesto al que él respondió viajando hacia el pasado para recuperar fotos de la madre de Bill, que había fallecido.
Algún tiempo después, Bill mencionó un charco de agua que una amiga, Heather, le había enseñado antes de su desaparición. Examinando el charco, el Doctor y Bill descubrieron que el charco estaba imitando sus movimientos en vez de reflejar su imagen como debería. Al anochecer, el charco, que había tomado la forma de Heather, los siguió hacia el despacho del Doctor y él se aseguró de que el charco no estaba interesado en la cámara, viendo que realmente los perseguía a ellos. Se llevó a Bill y a Nardole hacia varios lugares: Australia, un planeta al otro lado del universo en el futuro y una zona de guerra de la Guerra Dalek-Movellan; a pesar de esto, siguieron sin poder eludir al charco, que se desplazó por el espacio-tiempo tras ellos.
El Doctor descubrió que el charco no era una amenaza, sino que estaba persiguiendo a Bill a causa de una promesa que hizo Heather de no marcharse sin ella justo antes de ser absorbida por el charco. Bill liberó a Heather de su promesa y el charco se marchó, momento en el que el Doctor y Nardole llevaron a Bill de vuelta a la universidad con intenciones de borrar sus recuerdos de esta aventura. Cuando Bill le preguntó cómo se sentiría si le hicieran esto a él, el Doctor cambió de idea, permitiendo que se fuera manteniendo sus recuerdos. Tras discutir consigo mismo, el Doctor decidió invitar a Bill a acompañarlo en sus viajes y ella aceptó. (TV: The Pilot)
Distrayendo a Nardole, el Doctor se llevó a Bill a visitar una colonia humana situada en un futuro remoto, aunque no tardó en sospechar al ver que no había ningún humano en las instalaciones, sino que tan solo estaban los microbots Vardy que habían construido la colonia y su interfaz, los Emojibots. Cuando el Doctor descubrió que los Vardy habían matado al equipo de instalación, escapó del lugar con Bill, aunque luego regresó corriendo en un intento de destruir la base para salvar a los futuros colonos. El Doctor preparó la explosión de la nave en torno a la que se había construido el asentamiento, pero Bill le mostró que los colonos ya habían llegado en hibernación a la espera de que la nave los despertara y se habían despertado prematuramente. El Doctor impidió la explosión y el duo dedujo que los Vardy habían sido creados para mantener la felicidad, aunque con el tiempo pasaron a ver la tristeza como una plaga.
Buscando venganza por sus parientes fallecidos, los colonos empezaron a disparar a los Emojibots, causando el ataque de los Vardy. Notando que los Vardy habían pasado a ser conscientes, el Doctor los reinició, eliminando sus recuerdos de los humanos y dando inicio a negociaciones diplomáticas entre humanos y Vardy para una co-existencia pacífica. Habiendo logrado la paz, el Doctor y Bill regresaron a la TARDIS con el objetivo de volver a la universidad justo cuando se fueron, (TV: Smile) pero la TARDIS aterrizó en la "Frost Fair" de Londres en 1814.
Decidiendo explorar la feria, el Doctor y Bill notaron que había luces brillantes verdes bajo el hielo, pero fueron distraídos por una niña callejera, Kitty, antes de poder seguir investigando. Kitty los atrajo para que otro niño, Spider, robase el destornillador sónico del Docotr, pero el niño acabó siendo absorbido bajo el hielo poco después y no lograron salvarlo. El Doctor y Bill convencieron a Kitty para que los llevase al grupo de niños con el que vivía; allí, descubrieron que los niños estaban siendo pagados para atraer a personas hacia el hielo. El Doctor decidió sumergirse bajo el hielo junto con Bill para investigar qué pasaba en el Támesis y ambos descubrieron a una enorme criatura similar a un pez encadenada en el cauce del río. El Doctor descubrió que los deshechos de la criatura estaban siendo utilizados como suplemento de carbón, un proceso supervisado por Lord Sutcliffe.
Aunque acudieron a ver a Sutcliffe con la idea de actuar con sutileza, el Doctor acabó asaltando a Sutcliffe por su racismo hacia Bill y ambos fueron capturados por sus hombres. Sutcliffe reveló que su familia sabía acerca de la criatura marina desde hacía años y el combustible que proporcionaba estaba resultando en la aceleración del industrialismo. Los dejó atados en una tienda llena de dinamita, pero ambos lograron escapar. Mientras Bill y los niños se aseguraban de avisar a las personas para que huyesen de la feria, el Doctor llevó la dinamita hacia las cadenas de la criatura, liberándola cuando el propio Sutcliffe activó la explosión. El hielo se rompió y provocó la muerte de Sutcliffe mientras el Doctor rescataba a Bill sacándola del agua; justo después, la criatura marina pasó cerca de ellos.
Tras modificar el testamento de Sutcliffe y nombrar como su heredero a uno de los niños, el Doctor y Bill regresaron a la universidad, donde el Doctor aprovechó un truco con una moneda que había aprendido de uno de los niños para convencer a Nardole de que permitiese que él continuase viajando con Bill. (TV: Thin Ice) El Doctor y Bill empezaron a reunirse para sus viajes cada sábado. (TV: World Enough and Time)
Cuando Bill decidió alquilar una casa junto a algunos otros estudiantes de St Luke's University, le pidió ayuda al Doctor para poder transportar sus pertenencias utilizando la TARDIS. El Doctor la ayudó, aunque le parecía peculiar que una casa antigua y tan grande hubiese sido alquilada a Bill y a cinco jóvenes por tan poco dinero. Al investigar más, el Doctor vio que la casa no era moderna y estaba preparada, como mucho, para los años 1940. La casa empezó a devorar a los jóvenes uno por uno hasta que restaban únicamente Bill y el Doctor.
Ambos descubrieron que el arrendatario estaba usando insectos extraños para mantener a su madre viva en forma de madera; para ello, llevaba personas a ser devoradas por ellos cada 20 años. El Doctor convenció a la madre de que su hijo se equivocaba por haber preservado su vida de esta manera y consiguió liberar a las víctimas recientes de la casa, tras lo cual el arrendatario y su madre fueron consumidos por los insectos y la casa se colapsó. (TV: Knock Knock)
Ceguera
Con ganas de ver el universo otra vez, el Doctor respondió una llamada de auxilio originada en la estación espacial Chasm Forge, llevándose con él a Bill y también a Nardole, quien había intentado impedir que se fuera. Los tres se encontraron con una estación llena de cadáveres reanimados por sus smartsuits (trajes inteligentes) y vieron que el oxígeno era limitado a estos trajes, de modo que los vistieron. Fueron informados acerca de la situación por los supervivientes: Tasker, Ivan, Abby y Dahh-Ren. Cuando los supervivientes necesitaron escapar de la tripulación fallecida caminando hacia fuera de la situación, hubo un fallo en el smartsuit de Bill que le quitó el casco, dejándola expuesta al vacío del espacio. Ella perdió el conocimiento, pero el Doctor le dio su casco para salvarla, perdiendo su visión como consecuencia de la exposición al vacío.
El Doctor se dio cuenta de que los smartsuits estaban matando a las personas por haber sido diseñados así por la empresa que los creó, Ganymede Systems, para eliminar a los trabajadores que costaban más dinero. El Doctor enlazó los trajes de los supervivientes con el sistema de energía de la estación de modo que la estación entera explotaría si los smartsuits matasen a alguno de ellos. Al explicar a la inteligencia artificial de los trajes sus actos y el hecho de que sería malo para los negocios y Ganymede Systems perdería una gran cantidad de dinero, los trajes dejaron de ser hostiles, permitiendo al Doctor y a los supervivientes salir ilesos.
El Doctor llevó a los supervivientes a la Oficina Central de Ganymede Systems para que se quejasen y regresó con Bill y Nardole a su despacho de St Luke's University. Al quedarse a solas con Nardole, confesó que seguía sin recuperar su visión a pesar de que la apariencia de sus ojos parecía normal. (TV: Oxygen) El Doctor trató de ocultar su ceguera ante Bill y otros con los que llegó a interactuar, siendo Nardole el único consciente de ello. (TV: The Pyramid at the End of the World)
El Doctor usó sus gafas de sol sónicas para poder visualizar al menos ciertos aspectos y contornos que estuviesen delante de él. Estando en el exterior de la cámara, recibió un email titulado Extremis enviado por una contraparte virtual de él mismo para avisar de un ataque inminente. Para comprobar su veracidad, el Doctor llamó a Bill por teléfono y ella comentó que deseaba tener una cita con una chica llamada Penny, tal y como había hecho su contraparte virtual. El Doctor aconsejó a Bill que propusiera una cita a Penny, ya que iban a estar muy ocupados próximamente. Con esto, el Doctor se dispuso a prepararse para el día de la invasión. (TV: Extremis)
Una pirámide apareció de la nada en Turmezistan y el Doctor, como Presidente de la Tierra, fue solicitado para encargarse de la situación por el Secretario General de las Naciones Unidas. En la pirámide, el Doctor, Bill, Nardole, el Secretario General, el coronel estadounidense Don Brabbit, la oficial rusa Ilya Svyatoslavovich y el oficial chino Xiaolian presenciaron la visión de una Tierra apocalíptica creada por los Monjes, que demandaron que el planeta se rindiera para impedir ese futuro, necesitando el consentimiento de una persona. El Doctor se negó, pero el Secretario General accedió; no obstante, las razones de su consentimiento no eran las que buscaban y lo mataron.
Con la intención de determinar el motivo de la amenaza apocalíptica, el Doctor llegó a la conclusión de que se trataba de una bacteria que sería liberada en el mundo accidentalmente. Pirateando las cámaras de vigilancia de todos los laboratorios del mundo para saber cuál reactivarían los Monjes, el Doctor y Nardole descubrieron que era Agrofuel Research Operations y se dirigieron hacia el lugar para impedir la catástrofe mientras Bill, Brabbit, Svyatoslavovich y Xiaolian acudían a los Monjes para negociar.
En el laboratorio, tras pedir a Nardole que moviera la TARDIS y se fuera a una zona segura para no contaminarse, el Doctor fue informado por Erica de que un punto decimal puesto en el lugar equivocado había resultado en la creación de la bacteria mortal. Los sistemas de ventilación automáticos del laboratorio iban a liberar la bacteria hacia la atmósfera en poco tiempo, de modo que el Doctor preparó una explosión que esterilizaría el laboratorio y destruiría la bacteria antes de que se difundiese. Sin embargo, se quedó atrapado en la parte del laboratorio que estaba a punto de ser destruida, ya que con sus gafas de sol sónicas no podía leer el código para abrir la puerta.
Sin obtener respuestas de Nardole, el Doctor se comunicó con Bill y confesó que estaba ciego. Aunque el Doctor estaba dispuesto a morir debido a este error, Bill, que en este entonces era la única representante humana restante, rindió la Tierra a los Monjes dando su consentimiento a cambio de que restaurasen la visión del Doctor, ya que la Tierra lo necesitaba. El Doctor recuperó su visión y pudo escapar del laboratorio, pero fue informado telepáticamente por los Monjes de que con tal visión iba a ver el mundo que creaban. (TV: The Pyramid at the End of the World)
Rehabilitando a Missy
Los Monjes empezaron a reinar en la Tierra y así estuvieron durante seis meses, alterando la percepción de los humanos para hacer parecer que estuvieron allí durante millones de años guiando la humanidad. El Doctor aparecía en comunicados televisivos elogiando el trabajo de los Monjes y estuvo actuando como si fuera un prisionero vigilado por múltiples guardias, aunque esto era en realidad parte de un plan que ideó con Nardole y los guardias, quienes eran conscientes de la verdadera situación de invasión en la que se encontraban. Nardole llevó a Bill hacia el barco en el que estaba "capturado" el Doctor y él fingió estar aliado con los Monjes solo para ver cuál sería la reacción que tendría; Bill, muy perturbada ante lo que ve, disparó al Doctor y él pareció empezar a regenerarse, aunque segundos después lo detuvo y reveló a Bill que todo era una prueba para ver si ella estaba bajo la influencia de los Monjes o no.
Pese a este reencuentro, el Doctor carecía de opciones para enfrentarse a los Monjes, con lo que se vio obligado a acudir a Missy en la cámara para pedir su consejo. Missy, que mencionó haber tenido un encuentro con los Monjes previamente, dijo que su forma de mantener el control era emitiendo una señal con la historia falsa a sus víctimas usando las numerosas estatuas que habían construido por toda la Tierra, que activan un enlace psíquico teniendo en cuenta a la persona que originalmente dio su consentimiento para la invasión. Missy comenta que para derrotar a los Monjes durante su encuentro previo, tuvo que matar a esta persona, indicando al Doctor que el fallecimiento de Bill permitiría acabar con la invasión, ya que ella fue quien dio el consentimiento.
Negándose a aceptar esta solución, el Doctor se llevó a Bill, a Nardole y a los guardias hacia la pirámide de los Monjes con el fin de apoderarse de la emisión de la historia falsa con su propia mente para romper el enlace psíquico. El Doctor trató de enlazar su mente con la del Monje controlador, pero acabó siendo superado por su enemigo; fue entonces cuando Bill se dispuso a sacrificar su vida, pero empezaron a surgir imágenes de la madre de Bill. Reconociendo la fuerza que estos recuerdos proporcionaban a Bill, el Doctor se esforzó en hacer que ella se centrara en ellos y la humanidad pudo volver a la realidad y enfrentarse a los Monjes. El Doctor, Bill y Nardole contemplaron a los Monjes marchándose de la Tierra y, poco después, supieron que la humanidad iba a perder sus recuerdos de la invasión.
El Doctor volvió a visitar a Missy tras solventar el problema de los Monjes y ella se puso a llorar mientras hablaba con él, expresando arrepentimiento en relación con las personas cuyas muertes ella había provocado a lo largo de su vida. (TV: The Lie of the Land)
El Doctor, Bill y Nardole estuvieron en una central de la NASA, donde vieron que en la superficie de Marte estaba escrito con rocas el mensaje "DIOS SALVE A LA REINA". Los tres viajaron hacia Marte en el año 1881 para investigar, descubriendo que había un grupo de soldados humanos de la Gran Bretaña victoriana. La TARDIS se desmaterializó de repente con Nardole en su interior, dejando en Marte al Doctor y a Bill.
Hablando con los soldados, el Doctor y Bill vieron que convivían con un Guerrero de Hielo llamado Friday al que rescataron de su nave espacial que se había colisionado en África. Los soldados y Friday fueron juntos a Marte usando la tecnología de los Guerreros de Hielo, pudiendo respirar estando en el interior de una cueva. Friday permitió que los soldados empezaran a minar el planeta en busca de riquezas, pero el Doctor dedujo que en realidad Friday quería acceder al interior de una colmena de los Guerreros de Hielo. Los soldados acabaron abriendo el paso a la tumba de la Reina de Hielo Iraxxa, que yacía inconsciente en su interior y fue despertada accidentalmente por uno de los soldados.
Se produjo un enfrentamiento entre Iraxxa y los humanos, pero Friday le informó de que la superficie marciana era ahora inhabitable y el Doctor trató de hacerle tener misericordia y ver que los humanos podrían ayudar. Iraxxa accedió a dar una oportunidad a los humanos después de oír la opinión de Bill, única otra mujer presente, pero esta oportunidad fue desaprovechada cuando uno de los soldados disparó y la bala rozó el casco de Iraxxa, que respondió disparando también. El capitán Catchlove asumió el mando, dejó a Iraxxa y a Friday atrapados en la tumba (donde Iraxxa empezó a despertar a más Guerreros de Hielo) y encerró al Doctor, a Bill y al coronel Godsacre, que había estado al mando hasta ese punto.
Friday se desplazó hacia la celda del Doctor, Bill y Godsacre para aliarse con ellos, ya que no deseaba ningún conflicto. Los Guerreros de Hielo empezaron un asalto, pero el Doctor se apoderó del dispositivo de la minería y amenazó con enterrar a todos los presentes. Catchlove capturó a Iraxxa y la amenazó, pero Godsacre consiguió salvarla matando a Catchlove. Iraxxa puso fin al conflicto a cambio de que Godsacre jurara lealtad a su especie y el Doctor hizo contacto con Alpha Centauri para que proporcionara ayuda a los Guerreros de Hielo.
El Doctor y Bill ayudaron a Godsacre a dejar el mensaje que sería descubierto por la NASA y Nardole reapareció poco después, inesperadamente pilotada por Missy. Esto no agradó al Doctor, que le recordó que aquello iba en contra de su acuerdo y que tenía que llevarla de vuelta a la cámara. (TV: Empress of Mars)
El Doctor acabó decidiendo confiar en Missy y la liberó para que llevara a cabo tareas de mantenimiento en la TARDIS mientras él se llevaba a Bill y a Nardole a averiguar qué había pasado realmente con la Novena Legión del ejército romano en Escocia en el siglo II. Separándose de Bill, el Doctor y Nardole fueron capturados por un grupo de pictos y no tardaron en encontrarse con una langosta devoradora de luz que había sido liberada desde un portal a otra dimensión para enfrentarse al ejército romano. Ambos consiguieron escapar cuando el Doctor distrajo a los pictos con palomitas.
Cuando el Doctor entró en el montón de piedras en el que estaba el portal, Nardole se quedó fuera y se volvió a encontrar a los pictos. Aunque tan solo unos segundos habían pasado para el Doctor, dos días pasaron para Nardole, que entabló amistad con los pictos. Al salir el Doctor, empezaron a preparar un plan para derrotar a la criatura y se reunieron con Bill cuando ella apareció junto con un grupo de supervivientes de la Novena Legión. El trío hizo a ambos bandos trabajar juntos para salvar el mundo, algo que el Doctor logró a base de usar un dispositivo que convertía a la luz en veneno para obligar a la criatura a retroceder a su propia dimensión.
El Doctor escapó con Bill, Nardole y los pictos restantes después de que Kar y los romanos tomaran la decisión de acceder al portal para luchar contra el resto de las criaturas. A su regreso a la TARDIS, el Doctor se reunió con Missy para ver si realmente había aprendido algo y ella se puso a llorar. Ambos se preguntaron si había posibilidad de recuperar su amistad y si Missy finalmente se estaba convirtiendo en la persona que el Doctor deseaba que fuese. (TV: The Eaters of Light)
Para comprobar la bondad de Missy, el Doctor pidió a Bill y a Nardole que fuesen sus "acompañantes" y acudió a una nave colonial siguiendo una señal de auxilio. Mientras el Doctor observaba desde la TARDIS, Missy se presentó ante las cámaras como "Doctor Who", diciendo que era el nombre real del Doctor. Missy fue incapaz de lidiar con un miembro de la tripulación asustado y violento y este disparó a Bill, que fue llevada por pasajeros de un piso inferior.
El Doctor, Missy y Nardole bajaron en un ascensor hacia este piso y el Doctor dejó a Missy a cargo de obtener información de los ordenadores mientras investigaba con Nardole. Debido a proximidad de la nave a un agujero negro, el tiempo pasaba mucho más lentamente para los pisos inferiores que para el superior en el que se encontraban: años podían pasar abajo mientras un breve instante pasaba arriba. El Doctor y Nardole descubrieron las consecuencias de esto al encontrarse con Bill, sorprendiéndose tremendamente al ver que la habían convertido en un Cyberman Mondasiano. Missy fue hacia ellos acompañada por la encarnación predecesora de ella misma, el Amo "Saxon", que había estado viviendo en la nave y comentó que aquello era la "Génesis de los Cybermen". (TV: World Enough and Time)
Nardole escapó mientras los Amos atacaban al Doctor, que se las arregló para usar un ordenador durante el enfrentamiento y llevó a cabo una modificación en el algoritmo de los Cybermen para hacer que también persiguiesen a seres con dos corazones para convertirlos, lo cual incluía a Señores del Tiempo. El Doctor se quedó inconsciente tras la pelea y se despertó en el tejado ante las burlas de Missy y su predecesor, aunque ambos pasaron a preocuparse cuando vieron que los Cybermen venían a por ellos.
Nardole apareció en una lanzadera robada y recogió a los dos Amos, pero el Doctor fue electrocutado por un Cyberman antes de subir y quedó gravemente herido, perdiendo el conocimiento otra vez. La cyber-convertida Bill se encargó de transportarlo a la lanzadera, que fue pilotada por Nardole hasta colisionarse en el Piso 0507. El Doctor estuvo las dos semanas siguientes recuperándose en la granja solar del piso, estando bajo el cuidado de Hazran. Posteriormente, trató de ayudar a Bill a entender y aceptar su nueva realidad y ambos se dirigieron hacia una zona de un bosque en la que se encontraba Missy; por el camino, el Doctor sufrió los efectos iniciales de su regeneración, que era inminente a causa de sus heridas.
Missy les enseñó el ascensor oculto que había encontrado pero, al activarlo, alertó a todos los Cybermen del piso inferior sobre su posición; el Doctor tuvo que preparar defensas con los demás e idear un plan de evacuación para los habitantes del piso. Al ver que Missy y su predecesor planeaban marcharse antes del enfrentamiento, el Doctor fue tras ellos y los confrontó, rogando que se quedaran atrás para ayudar a los habitantes del piso con él; ambos se negaron, aunque Missy lo consideró durante un breve momento. Con el ataque de los Cybermen a punto de ocurrir, el Doctor convenció a Nardole para que se encargara de la evacuación hacia el Piso 0502. Tan solo Bill y el Doctor se quedaron atrás para el enfrentamiento.
Bill y el Doctor se separaron, cada uno quedándose en un extremo distinto del bosque. Los Cybermen aparecieron y el Doctor luchó contra ellos, destruyendo a todos los que pudo provocando explosiones en las líneas de combustible gracias a un hackeo de los sistemas realizado por Nardole. No obstante, el Doctor acabó recibiendo un disparo sorpresa seguido por múltiples otros. Todavía resistiendo su energía regenerativa, el Doctor provocó una ignición que llevó a múltiples explosiones, acabando con todos los Cybermen a su alrededor y, aparentemente, falleciendo con ellos. (TV: The Doctor Falls)
Negándose a cambiar
Algún tiempo después, el Doctor se despertó en la TARDIS tras ser trasladado hacia allí por Bill y Heather. Experimentando una regeneración retrasada, el Doctor declaró que no quería seguir viviendo teniendo que convertirse en otra persona y se esforzó al máximo para detener el proceso de regeneración. A modo de respuesta, la TARDIS lo llevó hacia un entorno nevado. (TV: The Doctor Falls) El Doctor salió al exterior todavía negándose a cambiar (TV: World Enough and Time) y metió sus manos en la nieve para hacer desaparecer la energía regenerativa.
Cerca de allí se encontraba un extraño que también decía en voz alta que se negaba a cambiar. Cuando el Doctor se identificó y le preguntó quién era, el extraño se acercó, revelando que era su primera encarnación. (TV: The Doctor Falls)
Si bien el Doctor aún se encontraba rehusándose a cambiar, el encuentro con su primera encarnación lo llevó a vivir una última aventura. De este modo, fue capaz de encontrarse con varios viejos amigos y enemigos, como Bill, Nardole, Clara y Rusty, aunque todos, con la excepción de este último eran solo Testimonios con los recuerdos de sus antiguos acompañantes. Asimismo, conoció al Capitán, un soldado de la Primera Guerra Mundial que había sido extraído con dificultades de su línea temporal, a fin de recolectar sus recuerdos. Tras viajar con el Capitán, Bill y su primera encarnación, los Doctores se vieron en la obligación de devolver al soldado al supuesto momento de su muerte. Sin embargo, resultó ser que el soldado no moriría en aquella oportunidad, pues el Duodécimo Doctor realizó pequeñas modificaciones para que los sucesos coincidiesen con la llamada Tregua de Navidad.
Fue, precisamente, este evento el que llevó al Doctor a reflexionar que podía existir bondad incluso en los más terribles momentos, lo cual le dio esperanza y le ayudó a tomar la decisión de regenerarse. Antes de ingresar a su TARDIS, el Doctor se despidió del Testimonio de Bill, quien le mostró la importancia de los recuerdos al otorgarle de vuelta sus recuerdos de Clara, a quien el Doctor pudo ver durante un breve instante. Poco después, un Testimonio de Nardole apareció y se despidió también del Doctor. Tras compartir un abrazo final con Bill y Nardole, estos últimos se desvanecieron y el Doctor ingresó a su TARDIS. (TV: Twice Upon a Time)
Muerte
En el interior de la TARDIS, el Doctor llegó a la conclusión de que una regeneración más no mataría a nadie, excepto a sí mismo. Luego de dar un discurso orientado a la encarnación que estaba próxima a llegar, en el cual le ofreció una serie de recomendaciones, el Doctor dio sus últimas palabras antes de regenerarse: "Doctor, yo te dejo ir".
Una gran cantidad de energía regenerativa fue expulsada de la cabeza y manos del Doctor conforme la regeneración continuaba. Al igual que en el caso de la regeneración de su décima encarnación, el proceso le causó un gran daño a la TARDIS. Tras finalizar la regeneración, el anillo del Doctor se deslizó del dedo de su nueva encarnación, cayendo al suelo. (TV: Twice Upon a Time)
Sucesos en fechas desconocidas
- El Duodécimo Doctor se unió a sus predecesores para ayudar a situar Gallifrey en un universo de bolsillo al final de la Última Gran Guerra del Tiempo. (TV: The Day of the Doctor)
- Hablando con una audiencia no vista, el Doctor explicó el funcionamiento de una paradoja de bootstrap refiriéndose a la situación hipotética de un hombre con una máquina del tiempo usando su conocimiento de Ludwig van Beethoven para viajar hacia atrás en el tiempo y convertirse sin querer en Beethoven como resultado. (TV: Before the Flood)
Apariencia
Mientras que muchos de sus predecesores, especialmente su predecesor directo, empezaron sus encarnaciones como el Doctor siendo bastante jóvenes, el Duodécimo Doctor tenía la apariencia de un hombre anciano desde un inicio. Tenía pelo canoso y corto, una nariz respingada, ojos color azul con toques plateados de vez en cuando, los cuales transmitían una agudeza notoria. También poseía orejas grandes. (TV: The Time of the Doctor) Su composición física era ligera, de poca corpulencia. (CÓMIC: Chime Time)
Lo que más cambió de su apariencia fue sin duda sus cejas, las cuales dejaron de ser "delicadas" (TV: The Time of the Doctor) para pasar a ser gruesas y pobladas. (TV: The Day of the Doctor) Sorprendido por el cambio, el Doctor las llamó "cejas de ataque", e incluso mencionó que podría "destapar botellas" con sus cejas y estás "estaban listas para crear su propio estado independiente". (TV: Deep Breath) Más adelante consideró que sus cejas eran excelentes cuando necesitaba asumir la postura de líder, pues hacían que se vea más serio. Descubrió esto cuando se convirtió en el cabecilla de la banda que robaría el Banco de Karabraxos. (TV: Time Heist)
Alto y muy delgado, fue descrito por Clara como un "insecto palo con cabello canoso", (TV: Listen) mientras que Robin Hood mencionó que era "blanco como leche". (TV: Robot of Sherwood) Shona McCullough lo describió como un "hombre esqueleto". (TV: Last Christmas)
Ropa
Inmediatamente después de su regeneración, el Doctor continuó utilizando la vestimenta de su predecesor, para luego vestir una capa que le "compró" a un vagabundo, aunque después robó el traje de uno de los droides para hacerse pasar por uno de estos.
Una vez que regresa a la TARDIS, sin embargo, el Doctor elige un nuevo atuendo y pasa a vestir una rebeca de color azul marino con una camisa de cuello blanca sin corbata, pantalones azules que llegan a cubrir sus tobillos en vez de ser demasiado cortos, y zapatos gruesos negros. Por encima de todo, llevaba una chaqueta grande de color azul oscuro con el interior de color rojo, en ocasiones llevándola con el primer botón cerrado. (TV: Deep Breath) Posteriormente en sus viajes, reemplaza la rebeca con un chaleco negro, que lleva junto con su camisa blanca. (TV: Flatline, Dark Water, Death in Heaven)
Aunque el abrigo Crombie permanece como un aspecto constante de su apariencia, otras partes de la vestimenta del Doctor varían, desde prendas que viste junto con la camisa de cuello blanca hasta simplemente camisas de vestir, ya sean de color lila (TV: Robot of Sherwood), azul oscuro (TV: Time Heist), o negra con un patrón de puntos blancos. (TV: Kill the Moon) En otras ocasiones, no lleva puesta la camisa, sino que viste un jersey negro con pequeños agujeros por delante que parecen estrellas centelleantes de un cielo nocturno. (TV: Listen, The Caretaker, In the Forest of the Night) En al menos una ocasión, vistió una sudadera negra con capucha por encima de la camisa. (TV: Last Christmas)
El Doctor eligió este aspecto con la intención de "buscar minimalismo", pero acabó sintiendo que obtuvo un resultado de "mago" tras solidificar su armario. (TV: Time Heist) Esto se demuestra cuando confunden al Doctor con un mago. (TV: Last Christmas) Además, este Doctor se mostraba dispuesto a utilizar disfraces, como por ejemplo en su "misión encubierta" para encontrar al Skovox Blitzer, aunque el disfraz consistía tan solo en un cambio de chaqueta. (TV: The Caretaker)
Estando a bordo de la nave Orient Express, el Doctor viste un atuendo muy formal que consiste en una chaqueta elegante negra de doble botonadura, pantalones negros, un chaleco gris, sus zapatos gruesos negros, una camisa blanca y una corbata negra. Posteriormente, se puso una versión negra de su atuendo normal. (TV: Mummy on the Orient Express)
Curiosidades
- Al igual que los Doctores Guerrero y Noveno, el Duodécimo Doctor debutó en televisión antes de que se emitiese la regeneración de su predecesor.
- Sus primeras palabras — "¡Riñones! ¡Tengo nuevos riñones!" — mantienen la tradición moderna de los nuevos Doctores comentando acerca de sus cuerpos. Previamente, el Décimo Doctor mencionó sus "nuevos dientes", (TV: The Parting of the Ways) y el Undécimo comprobó sus piernas. (TV: The End of Time)