כאשר אדון זמן גוסס, מנגנון ההתחדשות שלו פועל במטרה "להחיות אותו מחדש", כלומר, שכתוב מלא של כל תא בגופו של אדון הזמן על מנת לתקן אתן גופו, ביחד עם שכתוב המראה החיצוני, משתנה גם האישיות של אדון הזמן וגם טעמו ועדפותיו, ולעיתים גם מינו, ובעצם הוא הופך לאדם חדש. מנגנון ההתחדשות לא מעניק לאדוני הזמן חיי נצח, מכיוון שמספר ההתחדשויות שאדון זמן יכול לעבור מוגבל ל-13 התחדשויות. בנוסף, אדון זמן ימות במידה יהרג שוב בזמן תהליך ההתחדשות, אך כמה שעות לאחר ההתחדשות פצעיו יתרפאו מיד, למשל הדוקטור העשירי גידל יד חדשה לאחר שהקודמת נכרתה בקרב. (פלישת חג המולד) וריבר סונג ספגה עשרות כדורים מחיילים נאצים ללא פגע כשעה אחרי התחדשותה. (בואו נהרוג את היטלר)
בנוסף אנרגיית התחדשות יכולה לשמש לריפוי אחרים, לדוגמה כשריבר השתמשה בכל אנרגיית ההתחדשות הנותרה בה כדי לרפא את הדוקטור מהרעל שהיא נישקה אותו איתו. (בואו נהרוג את היטלר) והדוקטור האחד עשר השתמש באנרגיית ההתחדשות שלו כדי לרפא את המפרק השבור של ריבר (המלאכים כובשים את מנהטן)
קצב ההזדקנות של אדוני זמן בכל גוף שונה משל בני אדם, הדוקטור האחד עשר חי בגופו כ-700 שנה בטרנזלור ועוד כ-200 שנה לפני כן, ביחד כ-900 שנה לפני שהוא היה אמור למות מזקנה מכיוון שניצל את כל התחדשויותיו, (הוא נחשב מספר 11 למרות שיש את דוקטור המלחמה שלא נחשב בדרך כלל בספירת הדוקטורים, וגם הדוקטור העשירי התחדש אבל שמר על פניו בכך שהעביר את אנרגיית ההתחדשות ליד הכרותה שלו (סוף המסע) , וכך יוצא שהוא כבר התחדש 13 פעמים) אבל אדוני הזמן העניקו לו שם מחזור התחדשות חדש, כלומר עוד 13 התחדשויות.
שליטתו של הדוקטור בהתחדשות שלו היא תת מודעת ולא יותר, (למשל בהתחדשות של הדוקטור העשירי הוא ידע שזו ההתחדשות האחרונה שלו וכנראה חשב שאם נשארה לו תקופת חיים אחת כדאי שלפחות יהנה בה, וכך הדוקטור האחד עשר הוא בעל אופי קליל, מתרגש בקלות ומעט ילדותי) אבל אדוני זמן אחרים כמו המאסטר הראו שליטה רבה יותר על ההתחדשות שלהם ובחרו את הגיל והאופי של ההתחדשות הבאה שלהם לפי רצונם המפורש. (אוטופיה)
סיבות ההתחדשות של הדוקטור[]
לכל התחדשות של כל התגלמות של אדון זמן ישנה סיבה אחרת. להלן סיבה לכל התחדשות של אדון זמן הידוע בשם הדוקטור.
- הדוקטור הראשון - ככל הנראה הסייברמנים פגעו בו קשות והוא התמוטט והתחדש לנגד עיניהם של מלויו, בן ג'קסון ופולי רייט. ( הכוכב העשירי)
- הדוקטור השני - לאחר ששינה את ההיסטוריה, אדוני הזמן שפטו אותו וקבעו שבתור עונש הוא צריך לשנות את המראה שלו. למרות שנתנו לו את האופציה לבחור איך יראה, הוא לא אהב אף מראה שהציעו לו אדוני הזמן והם קבעו בשבילו איך יראה. החלפת הפנים עצמה לא נראתה על המסך, אך בפרק שלאחר מכן כבר הופיע הדוקטור השלישי. (משחקי המלחמה)
- הדוקטור השלישי - ספג קרינה קטלנית כשהיה במערה של מלכת העכבישים והתמוטט מול שרה ג'יין סמית וברידגיר לפטברידג' סיוארט. הדוקטור הרביעי היה נמרץ ביותר ונכנס לעניינים במהירות אם כי התנהג באופן מוזר מיד לאחר ההתחדשות. (כוכב העכבישים)
- הדוקטור הרביעי - נפל מתחנת רדיו גבוהה מאוד על כדור הארץ והתערבב עם דמות מסתורית שהופיעה בסיפור הזה בשם הצופה כדי להתחדש. מכיוון שצוות הסדרה הרגיש שהרעיון של "הצופה" לא היה מובן מספיק, הם הוסיפו קטע קריינות קצר של ניסה, מלוותו של הדוקטור באותו הזמן, בו היא מתייחסת אל הצופה ואומרת ש"הוא היה הדוקטור לאורך כל הזמן הזה" (לוגופוליס)
- הדוקטור החמישי - הוא ופרי הורעלו ואת התרופה היחידה הוא נתן לפרי. הוא כמעט מת בהתחדשות הזאת והוא אפילו אמר ש"זה מרגיש שונה הפעם" ושהוא לא בטוח שהוא עומד להתחדש. זו הייתה הפעם הראשונה והאחרונה שהדוקטור הנכנס הוצג בכתוביות הסיום לפני הדוקטור היוצא. (המערות של אנדרוזני)
- הדוקטור השישי - הראני ניסתה לפוצץ את הטארדיס ופגעה קשות בדוקטור וגרמה לו להתרסק על כוכב הלכת לאקרשייה ולהתחדש. זו הייתה הפעם הראשונה שהדוקטור התחדש בתחילת הסיפור ולא בסופו, זו גם הייתה הפעם הראשונה שהשחקן שגילם את הדוקטור לא גילם אותו בסצנת ההתחדשות. השאלה שעולה בהתחדשות זו היא איך הדוקטור נפגע כל כך קשה והתחדש בעוד המלווה שלו, מל, יצאה ללא פגע? בספר "משחקי ראש" נאמר כי ראשו של הדוקטור נחבט בחוזקה בקונסולה של הטארדיס, מה שבעצם גרם לו להתחדש. (זמן והראני)
- הדוקטור השביעי - נקלע לחילופי יריות של גנגסטרים בשנת 1999. בבית החולים הרופאים הרגו אותו בטעות והוא התחדש רק כמה שעות מאוחר יותר וכתוצאה מזה איבד את הזיכרון לפרק זמן קצר. (דוקטור הו: הסרט)
- הדוקטור השמיני - החללית בה שהה התרסקה, לאחר מכן הוא הוחזר לחיים לפרק זמן קצר כדי לבחור מה יהיה סוג ההתחדשות הבאה שלו (לילו של הדוקטור)
- דוקטור המלחמה - לאחר ששינה את סיום מלחמת הזמן ביחד עם 12 הדוקטורים האחרים הטארדיס גרמה לו להשתנות עקב הפרדוקס. (יומו של הדוקטור)
- הדוקטור התשיעי - לאחר שרוז השתמשה בלב הטארדיס כדי להשמיד את הדאלקים היא כמעט נהרגה ולכן הדוקטור שאב ממנה את הכוחות של לב הטארדיס, ונהרג בעצמו והתחדש. (התפצלות הדרכים)
- הדוקטור העשירי - ספג קרינה גרעינית מנורה גרעינית. מערכות הגוף שלו קרסו והוא התחדש. לפני התחדשותו הדוקטור הספיק לבקר את כל מלוויו ולעשות סגירת מעגל לתקופת הדוקטור העשירי (ולתקופתו של ראסל טי דייויס ככותב הראשי של הסדרה) אנרגיית ההתחדשות הייתה חזקה מאוד וגרמה נזק לטארדיס שלו, ובכך הטארדיס קיבלה מראה חדש בתחילת העונה החמישית. מילותיו האחרונות היו "אני לא רוצה ללכת (למות)". (סוף הזמן, חלק שני)
- הדוקטור האחד עשר - בתור ההתגלמות ה-13 של הדוקטור (התחדשות המטה-קרייסיסט של הדוקטור העשירי ודוקטור המלחמה נחשבים כהתגלמות) לא נשארה לו יותר האפשרות להתחדש. אדוני הזמן העניקו לו גלגל התחדשויות חדש עם 13 גילומים נוספים. לאחר התקפת דאלקים על טרנזלור, הדוקטור השתמש באנרגיית ההתחדשות שלו במטרה לעצור את הפלישה הדאלקית ואז התחדש בגלל זקנה. (זמנו של הדוקטור) ישנו גם מוות נוסף שבו ריבר סונג לכודה בחליפת אסטרונאוט והורגת את הדוקטור במהלך ההתחדשות שלו (האסטרונאוט הבלתי אפשרי) אך הדוקטור מרמה את המוות בכך שגרם ל"טסלקטה" להפוך לדוקטור ובכך ניצל מהמוות של עצמו.
- הדוקטור השניים עשר - במהלך מלחמה של הדוקטור נגד הסייברמנים בחללית שנמצאת קרוב לחור שחור ובה הזמן עובר מהר יותר בתחתיתה מאשר קומתה העליונה, אחד הסייברמנים מגרסת מונדס (גרסה ישנה שנראתה כשהסייברמנים הופיעו לראשונה) יורה בדוקטור ובתגובה הוא מפוצץ את האזור יחד איתו. ביל והת'ר (חברתה של ביל שבפתיחת העונה הפכה לחייזר העשוי ממים ובסוף העונה הפכה גם את ביל לכזה) החזירו את הדוקטור לטארדיס, איפה שיוכל לנוח בשלווה, ואז הולכות. הדוקטור נוחת באזור מושלג, עוצר את ההתחדשות ופוגש את הדוקטור הראשון. בסופו של דבר הדוקטור נכנס לטארדיס והתחדש, כמו עם הדוקטור העשירי, ההתחדשות שלו עוצמתית וגורמת לטארדיס לפלוט אותו החוצה ביחד עם כל תוכנה. (מספיק עולם וזמן, הדוקטור נופל, היו היה פעמיים)